[发明专利]用于检测念珠菌属物种的方法和组合物

摘要

公开了利用念珠菌属物种靶核酸的特异性扩增来检测样本中念珠菌属物种的存在或不存在的方法。还公开了相应的寡聚体，包括扩增寡聚体，捕获探针和检测探针及其组合，以及相应的反应混合物和试剂盒。

主权项

1.一种用于确定样本中念珠菌属物种的存在或不存在的方法，所述方法包括：(1)使样本与第一扩增寡聚体组合和第二扩增寡聚体组合中的至少一种接触，所述样本疑似含有念珠菌属物种，其中(a)所述第一扩增寡聚体组合包含用于扩增第一念珠菌属物种靶核酸区域或第二念珠菌属物种靶核酸区域的第一和第二念珠菌特异性扩增寡聚体，其中所述第一靶区域对应于从约第133或161位核苷酸至约第259位核苷酸的SEQ ID NO：129的区域，并且所述第二区域对应于从约第202位核苷酸至约第308位核苷酸的SEQ ID NO：130的区域，并且其中所述第一和第二念珠菌特异性扩增寡聚体分别包含第一和第二念珠菌特异性靶杂交序列；并且(b)所述第二扩增寡聚体组合包含用于扩增第三念珠菌属物种靶核酸区域的第一和第二光滑念珠菌特异性扩增寡聚体，其中所述第三靶区域对应于从约第355位核苷酸至约第554位核苷酸的SEQ ID NO：131的区域，并且其中所述第一和第二光滑念珠菌特异性扩增寡聚体分别包含第一和第二光滑念珠菌特异性靶杂交序列；(2)进行体外核酸扩增反应，其中可能存在于所述样本中的任何念珠菌属物种靶核酸被用作模板以产生对应于所述第一、第二和第三靶区域中的至少一个的一种或多种扩增产物；以及(3)检测所述一种或多种扩增产物的存在或不存在，从而确定所述样本中念珠菌属物种的存在或不存在。