[发明专利]用于现场或基于云的DNA和RNA处理和分析的基因组学基础架构有效

专利信息
申请号: 201780006359.1 申请日: 2017-01-11
公开(公告)号: CN108604260B 公开(公告)日: 2022-06-10
发明(设计)人: 彼得·范罗文;罗伯特·J·麦克米伦;迈克尔·吕勒;拉米·米尔 申请(专利权)人: 艾迪科基因组公司
主分类号: G16B50/40 分类号: G16B50/40;G16B50/10;G16B30/20;G16B30/10
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 郝传鑫;熊永强
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 用于对基因序列数据执行序列分析管道的系统、方法和设备,包括集成电路,该集成电路由一组硬连线数字逻辑电路形成,该硬连线数字逻辑电路通过多个物理电气互连进行互连。其中一个物理电气互连形成与电子数据源连接的该集成电路的输入,用于接受基因组数据read。该硬连线数字逻辑电路被布置为一组处理引擎,每个处理引擎由硬连线数字逻辑电路的子集形成,以对基因组数据read执行序列分析管道中的一个或多个步骤。硬连线数字逻辑电路的每个子集为有线配置,执行序列分析管道中的一个或多个步骤。
搜索关键词: 用于 现场 基于 dna rna 处理 分析 基因组 基础 架构
【主权项】:
1.一种用于现场或基于云的DNA和RNA处理和分析的基因组学基础架构,所述基因组学基础架构包括:平台API,其定义用于接收来自二级处理的结果数据的多个DNA或RNA序列数据read的输入;和多个用户可选择的DNA或RNA处理管道,每个管道具有根据所述平台API定义的输入,以接收来自二级处理的结果数据,所述多个DNA或RNA处理管道具有公共管道API,其定义对根据平台API接收的来自二级处理的结果数据执行的三级处理操作,其中所述多个DNA或RNA处理管道中的每一个被配置为执行所述三级处理操作的操作子集,用户选择的一组DNA或RNA处理管道被配置用于根据所述管道API输出三级处理的结果数据。
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