[发明专利]变异引物的设计方法在审
申请号: | 201780020530.4 | 申请日: | 2017-02-06 |
公开(公告)号: | CN109072221A | 公开(公告)日: | 2018-12-21 |
发明(设计)人: | 高石真 | 申请(专利权)人: | 大研医器株式会社 |
主分类号: | C12N15/09 | 分类号: | C12N15/09;C12Q1/6806;G06F19/20 |
代理公司: | 上海弼兴律师事务所 31283 | 代理人: | 薛琦 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | 本发明提供不易发生由引物二聚体或环结构导致的非特异性扩增的变异引物的新的设计方法。一种引入了变异的引物的设计方法,其中,具备选择基础引物序列所含的、符合选自以下的(1)~(4)的1个或2个以上的条件的1个或2个以上的核苷酸残基作为变异引入部位的变异引入部位选择工序:(1)可能会有助于引物二聚体的形成的核苷酸残基;(2)可能会有助于1分子引物内的环结构的形成的核苷酸残基;(3)预测由所述基础引物序列形成的引物形成引物二聚体的情况下,位于引物互补或非互补杂交的区域以外的区域的核苷酸残基;(4)预测由所述基础引物序列形成的引物在1分子内形成环结构的情况下,位于构成环结构的区域以外的区域的核苷酸残基。 | ||
搜索关键词: | 引物 核苷酸残基 环结构 引物二聚体 引物序列 引入 部位选择 非特异性 引物互补 预测 扩增 杂交 | ||
【主权项】:
1.一种设计方法,它是用于核酸扩增法的引入了变异的引物的设计方法,其中,具备设计与模板DNA完全互补的碱基序列作为基础引物序列的基础序列设计工序,以及选择该基础引物序列所含的、符合选自以下的(1)~(4)的1个或2个以上的条件的1个或2个以上的核苷酸残基作为变异引入部位的变异引入部位选择工序:(1)可能会有助于引物二聚体的形成的核苷酸残基;(2)可能会有助于1分子引物内的环结构的形成的核苷酸残基;(3)预测由所述基础引物序列形成的引物形成引物二聚体的情况下,位于引物互补或非互补杂交的区域以外的区域的核苷酸残基;(4)预测由所述基础引物序列形成的引物在1分子内形成环结构的情况下,位于构成环结构的区域以外的区域的核苷酸残基。
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