[发明专利]用于确定微生物的存在和鉴定所述微生物的方法、系统和计算机程序产品

摘要

一种确定至少一种确定的微生物在含一种或多种微生物菌落和培养基的培养皿中的存在的方法和系统及包含被执行时执行本发明方法的指令的计算机可读介质。方法包括获得培养皿的初始图像并对图像应用第一处理来获得像素仅与微生物菌落关联的第一处理图像；对第一处理图像应用第二处理来获得像素与微生物菌落及其周围区关联的第二处理图像；计算初始和第二处理图像间的差异以获得像素仅与培养基关联的第三处理图像；计算第二和第一处理图像间的差异以获得像素仅与周围区关联的第四处理图像；对每个颜色通道计算第三和第四处理图像的平均像素差值来确定特征值；对特征值分类来确定微生物存在指示符值；比较该值与阈值以确定该确定的微生物的存在。

主权项

1.一种用于确定至少一种确定的微生物在包含一种或更多种微生物菌落和培养基的培养皿中的存在的方法，所述培养基适于允许所述一种或更多种微生物菌落和所述至少一种确定的微生物，如果存在的话，在合适的生长条件下生长，所述方法包括：‑获得所述培养皿的至少一个初始图像，其中第一初始图像包括一个或更多个可见像素，每个像素与像素值相关联；‑通过对所述至少一个初始图像应用第一处理获得所述培养皿的第一处理图像，其中所述第一处理图像的可见像素仅涉及与所述一种或更多种微生物菌落相关联的像素；‑通过对所述第一处理图像应用第二处理获得所述培养皿的多于一个第二处理图像，其中所述第二处理图像的可见像素仅涉及与所述一种或更多种微生物菌落和所述一种或更多种微生物菌落周围的周围区相关联的像素；‑通过计算所述至少一个初始图像和所述多于一个第二处理图像之间的差异获得所述培养皿的多于一个第三处理图像，其中所述多于一个第三处理图像包括仅涉及与所述培养基相关联的像素的可见像素；‑通过计算所述多于一个第二处理图像和所述第一处理图像之间的差异获得所述培养皿的多于一个第四处理图像，其中所述多于一个第四处理图像的可见像素仅涉及与所述周围区相关联的像素；‑通过针对红绿蓝(RGB)颜色通道的至少每个颜色通道计算所述多于一个第三处理图像的平均像素值和所述多于一个第四处理图像的平均像素值之间的差值，确定与所述多于一个所述第三处理图像和所述多于一个第四处理图像相关联的特征值；‑通过对所确定的特征值进行分类来确定所述至少一种确定的微生物在所述培养皿中的所述周围区内的存在的指示符的值；‑将所述指示符的值与阈值进行比较；‑根据比较的结果来确定所述至少一种确定的微生物在所述培养皿中的所述周围区内的存在。