[发明专利]使用共识基因库和基于网络的数据结构的表型/疾病特异性基因排序

摘要

本发明涉及用于从高通量生物和化学测定平台捕获、整合、组织、导航和查询大规模数据的方法、系统和装置。它提供了一个高效的荟萃分析基础设施，用于对来自不同生物和化学测试、数据类型和生物体的大量研究和实验进行研究查询，并提供了构建和添加到此类基础设施的系统。根据各种实现方案，用于识别可能与感兴趣的生物学、化学或医学概念相关的基因的方法、系统和界面。

主权项

1.一种在包括一个或多个处理器和系统存储器的计算机系统上实现的方法，其用于识别可能与感兴趣的生物学、化学或医学概念相关的基因，该方法包括：(a)通过一个或多个处理器，从数据库选择多个基因集，其中，所述多个基因集中的每个基因集包含多个基因和与所述多个基因相关的多个实验值，并且其中，所述多个实验值在至少一个实验中与感兴趣的生物学、化学或医学概念相关；(b)对于每个基因集，通过一个或多个处理器，使用所述多个基因中的第一组一个或多个基因的一个或多个实验值确定第一组一个或多个基因的一个或多个实验基因得分；(c)对于每个基因集，通过一个或多个处理器，至少部分地基于第一组一个或多个基因与第二组一个或多个基因的相关性，确定所述多个基因中的第二组一个或多个基因的一个或多个计算机基因得分，其中，第一组一个或多个基因与第二组一个或多个基因的相关性在所述数据库中的除所述多个基因集外的其他基因集中指示；(d)通过一个或多个处理器，至少部分地基于步骤(b)中确定的第一组一个或多个基因的一个或多个实验基因得分和步骤(c)中确定的第二组一个或多个基因的一个或多个计算机基因得分，获得第一组一个或多个基因和第二组一个或多个基因的总分，其中，每个总分跨所述多个基因集汇集得到；和(e)通过一个或多个处理器，使用第一组一个或多个基因和第二组一个或多个基因的总分，识别可能与所述感兴趣的生物学、化学或医学概念相关的基因。