[发明专利]一种二代序列和三代序列基因组联合的组装方法和系统在审
| 申请号： | 201780084138.6 | 申请日： | 2017-04-01 |
| 公开（公告）号： | CN110313033A | 公开（公告）日： | 2019-10-08 |
| 发明（设计）人： | 邓天全;高强;杨林峰;杨鑫;贺丽娟;刘亚斌;岳震;霍守江;肖黎 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人： | 刘锴;周瑞 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 暂无信息 | 说明书： | 暂无信息 |
| 摘要： | 本发明公开了一种二代序列和三代序列基因组联合的组装方法和系统，所述方法包括如下步骤：(1)提取样品基因组并超声打断；(2)将步骤(1)超声打断的片段凝胶纯化并切胶，以构建不同插入片段的文库；(3)将步骤(2)得到的文库进行二代双末端测序；(4)将各个文库的二代双末端测序的读1和读2进行拼接；(5)将拼接后的序列进行序列组装；(6)将步骤(5)得到的重叠群比对到三代序列数据中，进行联合组装；其中，所述二代双末端测序的读1和读2的序列有5bp以上的重叠区域。本方法和系统能够延长二代序列的平均长度。 | ||
| 搜索关键词： | 末端测序 基因组 文库 组装 超声 拼接 打断 片段凝胶纯化 重叠群比对 插入片段 序列数据 序列组装 重叠区域 联合 构建 切胶 | ||
【主权项】：
PCT国内申请，权利要求书已公开。
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