[发明专利]一种利用文本比对分析高通量测序基因表达水平的方法有效
| 申请号： | 201810075940.5 | 申请日： | 2018-01-26 |
| 公开（公告）号： | CN108388772B | 公开（公告）日： | 2022-01-25 |
| 发明（设计）人： | 宋东光 | 申请（专利权）人： | 佛山科学技术学院 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10 |
| 代理公司： | 广东广信君达律师事务所 44329 | 代理人： | 杨晓松 |
| 地址： | 528000 广东省佛山市*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明属于生物信息学领域，提供了一种分析高通量测序序列基因表达量的方法，首先对测序序列进行编码、打散、随机组合，选取其中10万条序列作为查询序列分别与100万条序列进行比对，从每个查询序列随机选取9组20mer比对100万条序列去重后获得该序列的转录数量。利用查询序列首尾20mer从匹配的比对重叠群进行拼接。合并所有查询序列组比对表达数量即得到了该拼接序列的表达量，与用互补链进行比对得到的负链表达量相当。本方法可以有效用于高通量测序基因表达量及进行序列从头组装等分析。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 利用 文本 分析 通量 基因 表达 水平 方法 | ||
【主权项】：
1.一种分析高通量测序基因表达水平的方法，其特征在于，包含以下步骤：S1.获取待分析样本的高通量测序信息；S2.序列加编号，打散，随机组合；S3.选取上述步骤S2中的10万条序列作为查询序列，将10万条查询序列与100万条序列进行比对后统计查询序列表达量；S4.将步骤S3中，10万条查询序列与100万条序列比对得到的序列进行重叠群拼接；S5.重叠群序列的比对以及注释提取。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于佛山科学技术学院，未经佛山科学技术学院许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201810075940.5/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇：一种生物多样性自动分析方法
- 下一篇：一种肿瘤新生抗原的鉴定方法
