[发明专利]一种基于标记位点基因型含有误差的多性状多区间定位方法有效

专利信息
申请号: 201810083627.6 申请日: 2018-01-29
公开(公告)号: CN108197435B 公开(公告)日: 2022-02-25
发明(设计)人: 佟良;周影;马春华;孙晓霞;邹大伟;付丽;耿艳秋 申请(专利权)人: 绥化学院
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B20/30;G16B25/10
代理公司: 哈尔滨市伟晨专利代理事务所(普通合伙) 23209 代理人: 张伟
地址: 152061 *** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要: 发明给出一种基于标记位点基因型含有误差的多性状多区间定位方法,包括:获取分子遗传图谱;确定出第i个标记区间两侧标记之间的重组率γi和第i个标记区间内QTL与上标记位点之间的重组率γi1;根据所述第i个标记区间两侧标记之间的重组率γi和第i个标记区间内QTL与上标记位点之间的重组率γi1产生标记基因型和QTL基因型;根据配置的误差率获得含有误差的标记基因型;配置参数真值;通过模型得到表型性状观察值;配置参数初值;迭代通过EM算法推导出的参数表达式直至收敛;重复循环N次得到参数估计的平均值和均方误差作为目标值。本发明能很好的解决标记基因信息含有误差这一问题,并能够估算标记基因信息的误差率。
搜索关键词: 一种 基于 标记 基因型 含有 误差 性状 区间 定位 方法
【主权项】:
1.一种基于标记位点基因型含有误差的多性状多区间定位方法,其特征在于,包括:步骤一、获取分子遗传图谱;步骤二、确定出第i个标记区间两侧标记之间的重组率γi和第i个标记区间内QTL与上标记位点之间的重组率γi1;步骤三、根据所述第i个标记区间两侧标记之间的重组率γi和第i个标记区间内QTL与上标记位点之间的重组率γi1产生标记基因型和QTL基因型;步骤四、根据配置的误差率获得含有误差的标记基因型;步骤五、配置参数真值;步骤六、通过模型得到表型性状观察值;步骤七、配置参数初值;步骤八、迭代通过EM算法推导出的参数表达式直至收敛;步骤九、重复循环N次得到参数估计的平均值和均方误差作为目标值。
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