[发明专利]单细胞网络调控关系的构建方法在审

专利信息
申请号: 201810132369.6 申请日: 2018-02-09
公开(公告)号: CN108090326A 公开(公告)日: 2018-05-29
发明(设计)人: 宁丽峰;周越;邱顺晨;李鹏 申请(专利权)人: 国家卫生计生委科学技术研究所
主分类号: G06F19/20 分类号: G06F19/20
代理公司: 北京冠和权律师事务所 11399 代理人: 朱健;陈国军
地址: 100000 *** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明公开的单细胞网络调控关系的构建方法,包括:对表达调控数据的样本空间进行聚类,并剔除样本空间中的异常值;根据剔除了异常值的样本空间,得到功能单元相关性矩阵;对所述功能单元相关性矩阵进行稀疏化处理,得到稀疏化处理过的功能单元相关性矩阵;根据所述稀疏化处理过的功能单元相关性矩阵,进行网络调控关系计算;根据所述网络调控关系,划分调控功能模块;以hdf5格式存储用于识别调控功能模块的拓扑相似性矩阵。
搜索关键词: 矩阵 功能单元 网络调控 稀疏化处理 样本空间 调控功能 构建 剔除 相似性矩阵 表达调控 格式存储 关系计算 聚类 拓扑
【主权项】:
1.一种单细胞网络调控关系的构建方法,其特征在于,包括步骤:对表达调控数据的样本空间进行聚类,并剔除样本空间中的异常值;根据剔除了异常值的样本空间,得到功能单元相关性矩阵;对所述功能单元相关性矩阵进行稀疏化处理,得到稀疏化处理过的功能单元相关性矩阵;根据所述稀疏化处理过的功能单元相关性矩阵,进行网络调控关系计算;根据所述网络调控关系,划分调控功能模块;以hdf5格式存储用于识别调控功能模块的拓扑相似性矩阵。
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