[发明专利]一种全基因组关联分析方法、系统及电子设备在审
| 申请号： | 201810133320.2 | 申请日： | 2018-02-07 |
| 公开（公告）号： | CN110211631A | 公开（公告）日： | 2019-09-06 |
| 发明（设计）人： | 郭宁;魏彦杰;张慧玲;郑志春;葛健秋;冯圣中 | 申请（专利权）人： | 深圳先进技术研究院 |
| 主分类号： | G16B20/20 | 分类号： | G16B20/20;G16B30/00;G16B40/30 |
| 代理公司： | 深圳市科进知识产权代理事务所(普通合伙) 44316 | 代理人： | 赵勍毅 |
| 地址： | 518055 广东省深圳*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本申请属于基因数据处理技术领域，特别涉及一种全基因组关联分析方法、系统及电子设备。所述全基因组关联分析方法包括：步骤a：对样本的原始测序数据进行SNP点位确定，得到样本的SNP位点信息；步骤b：建立基于参考基因组SNP信息的坐标轴，并根据基于参考基因组SNP信息的坐标轴对样本的SNP位点信息进行特征提取，得到样本的特征向量；步骤c：将样本的特征向量进行聚类，得到样本的代表特征向量，并将所述代表特征向量进行合并，得到非冗余样本。本申请通过将原始数据进行聚类，对样本进行特征表达，找到重要的特征，降低数据的计算量，根据各个样本之间的相似度，将相似度高的样本合并起来，去掉其余的样本，大大降低了内存的需求，提高了效率。 | ||
| 搜索关键词： | 样本 特征向量 关联分析 全基因组 电子设备 基因组 相似度 坐标轴 聚类 数据处理技术 测序数据 点位确定 特征表达 特征提取 原始数据 非冗余 计算量 参考 合并 申请 内存 基因 | ||
【主权项】：
1.一种全基因组关联分析方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤a：对样本的原始测序数据进行SNP点位确定，得到样本的SNP位点信息；步骤b：建立基于参考基因组SNP信息的坐标轴，并根据基于参考基因组SNP信息的坐标轴对样本的SNP位点信息进行特征提取，得到样本的特征向量；步骤c：将样本的特征向量进行聚类，得到样本的代表特征向量，并将所述代表特征向量进行合并，得到非冗余样本。
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