[发明专利]一种检测LRP2基因SNP位点rs2544390基因型的方法在审

专利信息
申请号: 201810134450.8 申请日: 2018-02-09
公开(公告)号: CN108179183A 公开(公告)日: 2018-06-19
发明(设计)人: 车团结;徐红;陈游;杨震;李亚鹏 申请(专利权)人: 苏州百源基因技术有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12N15/11
代理公司: 北京中恒高博知识产权代理有限公司 11249 代理人: 吕玉博
地址: 215163 江苏省*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明提供一种检测LRP2基因SNP位点rs2544390基因型的方法,步骤如下:构建重组阴性质粒和重组阳性质粒;提取待测样本的外周血基因组DNA,对重组阴性质粒、重组阳性质粒和待测样本的DNA均进行PCR扩增和HRM分析,收集数据;根据收集数据绘制高分辨率熔解曲线,根据重组阴性质粒、重组阳性质粒的熔解曲线判断待测样本LRP2基因SNP位点rs2544390的基因型。本发明的方法能够准确检测LRP2基因SNP位点rs2544390的基因型,灵敏度高,特异性好,检测迅速;应用本发明的方法对LRP2基因SNP位点rs2544390基因型的分型与测序结果完全一致,能够用于痛风易患性的辅助判断。
搜索关键词: 基因型 待测样本 阳性质粒 阴性质粒 基因 熔解曲线 收集数据 种检测 基因组DNA 痛风 高分辨率 准确检测 灵敏度 外周血 易患性 测序 分型 构建 绘制 检测 应用 分析
【主权项】:
1.一种检测LRP2基因SNP位点rs2544390基因型的方法,其特征在于:步骤如下:(1)构建重组阴性质粒和重组阳性质粒:所述重组阴性质粒的核苷酸序列为序列表中SEQ ID No.1,所述重组阳性质粒的核苷酸序列为序列表中SEQ ID No.2;(2)提取待测样本的外周血基因组DNA,对重组阴性质粒、重组阳性质粒和待测样本的DNA均进行PCR扩增和HRM分析,收集数据;作为优选,所述HRM分析的条件为:94℃90s;60℃30s;83‑94℃收集数据,温度上升速率为0.06℃/s;(3)根据收集数据绘制高分辨率熔解曲线,根据重组阴性质粒、重组阳性质粒的熔解曲线判断待测样本LRP2基因SNP位点rs2544390的基因型:与重组阴性质粒的熔解曲线重合则LRP2基因SNP位点rs2544390的基因型为GG;与重组阳性质粒的熔解曲线重合则LRP2基因SNP位点rs2544390的基因型为AA;在重组阴性质粒和重组阳性质粒之间的则LRP2基因SNP位点rs2544390的基因型为GA。
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