[发明专利]一种检测NLRP3基因SNP位点rs3806268基因型的方法在审
| 申请号： | 201810134483.2 | 申请日： | 2018-02-09 |
| 公开（公告）号： | CN108103166A | 公开（公告）日： | 2018-06-01 |
| 发明（设计）人： | 车团结;徐红;陈游;杨震;李亚鹏 | 申请（专利权）人： | 苏州百源基因技术有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6858 | 分类号： | C12Q1/6858;C12Q1/6883 |
| 代理公司： | 北京中恒高博知识产权代理有限公司 11249 | 代理人： | 吕玉博 |
| 地址： | 215163 江苏省*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明提供一种检测NLRP3基因SNP位点rs3806268基因型的方法，步骤如下：构建重组阴性质粒和重组阳性质粒；提取待测样本的外周血基因组DNA，对重组阴性质粒、重组阳性质粒和待测样本的DNA均进行PCR扩增和HRM分析，收集数据；根据收集数据绘制高分辨率熔解曲线，根据重组阴性质粒、重组阳性质粒的熔解曲线判断待测样本NLRP3基因SNP位点rs3806268的基因型。本发明的方法能够准确检测NLRP3基因SNP位点rs3806268的基因型，灵敏度高，特异性好，检测迅速；应用本发明的方法对NLRP3基因SNP位点rs3806268基因型的分型与测序结果完全一致，能够用于痛风的辅助判断。 | ||
| 搜索关键词： | 基因型 待测样本 阳性质粒 阴性质粒 基因 熔解曲线 收集数据 种检测 基因组DNA 痛风 高分辨率 准确检测 灵敏度 外周血 测序 分型 构建 绘制 检测 应用 分析 | ||
【主权项】：
1.一种检测NLRP3基因SNP位点rs3806268基因型的方法，其特征在于：步骤如下：(1)构建重组阴性质粒和重组阳性质粒：所述重组阴性质粒的核苷酸序列为序列表中SEQ ID No.1，所述重组阳性质粒的核苷酸序列为序列表中SEQ ID No.2；(2)提取待测样本的外周血基因组DNA，对重组阴性质粒、重组阳性质粒和待测样本的DNA均进行PCR扩增和HRM分析，收集数据；作为优选，所述HRM分析的条件为：94℃ 90s；60℃ 30s；83-94℃收集数据，温度上升速率为0.06℃/s；(3)根据收集数据绘制高分辨率熔解曲线，根据重组阴性质粒、重组阳性质粒的熔解曲线判断待测样本NLRP3基因SNP位点rs3806268的基因型：与重组阴性质粒的熔解曲线重合则NLRP3基因SNP位点rs3806268的基因型为GG；与重组阳性质粒的熔解曲线重合则NLRP3基因SNP位点rs3806268的基因型为AA；在重组阴性质粒和重组阳性质粒之间的则NLRP3基因SNP位点rs3806268的基因型为GA。
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