[发明专利]弥漫型胃癌的分子分型、用于分型的蛋白标志物及其筛选方法和应用

摘要

本发明提供弥漫型胃癌的分子分型、用于分型的蛋白标志物及其筛选方法和应用，包括84例弥漫型胃癌样本癌与癌旁的组织蛋白表达谱数据，基于蛋白表达谱数据对胃癌进行分型的方法以及用于胃癌分型的199个蛋白标志物。采用这种方法可将Lauren分型中的弥漫型胃癌进一步分为三中亚型，分别为细胞周期型弥漫型胃癌PX1、上皮‑间充质转化型弥漫型胃癌PX2和免疫富集型弥漫型胃癌PX3。本发明提供了一种对胃癌进行分类、诊断和预后的方法，为弥漫型胃癌的预后以及设计靶向药物奠定了基础。

主权项

1.弥漫型胃癌亚型，包括：第一亚型为细胞周期型弥漫型胃癌PX1，第二亚型为上皮‑间充质转化型弥漫型胃癌PX2，第三亚型为免疫富集型弥漫型胃癌PX3；三个亚型存在以下临床特征差异或分子特征差异：所述临床特征方面差异包括：(1)三个亚型的肿瘤原发部位差异显著(Fisher’s精确检验P＝0.000)，一半以上的PX3样本原发部位在胃窦区；(2)三个亚型的癌旁组织性质差异显著(Fisher’s精确检验P＝0.001)，3/4以上的PX2样本的癌旁只是有浅表性胃炎，不是慢性萎缩性胃炎或肠化生；(3)三个亚型的总生存时间差异显著(Kaplan–Meier分析P＝0.038)；所述分子特征方面的差异为：(A)PX1和PX2中癌和癌旁差异表达的蛋白富集在细胞周期和DNA复制相关通路，而PX3中癌和癌旁差异表达的蛋白未富集在细胞周期或DNA复制相关通路中；(B)PX1‑PX3中癌和癌旁差异表达的蛋白均富集在E2F靶基因和MYC靶基因的基因集中，但PX1在这些通路中的富集程度更高；(C)PX1中癌和癌旁差异表达的蛋白富集在RNA处理和DNA修复相关通路，而PX2和PX3中癌和癌旁差异表达的蛋白未富集在这些通路中；(D)PX2和PX3中癌和癌旁差异表达的蛋白富集在上皮‑间充质转化过程、补体、细胞外基质和干扰素gamma响应的相关通路中，而PX1中癌和癌旁差异表达的蛋白未富集在这些通路中；(E)PX3中癌和癌旁差异表达的蛋白富集在NFKB介导的TNF‑alpha信号通路、免疫响应和细胞粘附的相关通路中，而PX1和PX2中癌和癌旁差异表达的蛋白未富集在这些通路中。