[发明专利]一种基于遗传属性约简的古生物谱系演化分析方法有效

专利信息
申请号: 201810161963.8 申请日: 2018-02-27
公开(公告)号: CN108509764B 公开(公告)日: 2020-06-16
发明(设计)人: 冯筠;杜丽媛;冯宏伟;刘建妮;韩健;王红玉 申请(专利权)人: 西北大学
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00;G16B10/00
代理公司: 西安恒泰知识产权代理事务所 61216 代理人: 张明
地址: 710069 *** 国省代码: 陕西;61
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摘要: 发明公开了一种基于遗传属性约简的古生物谱系演化分析方法,该方法的基本步骤包括:建立谱系种树;利用遗传属性约简算法构造谱系种树中每个节点的概念样例模板集合,将其作为决策依据,建立概念决策种树;利用物种属性和种树概念样例模板的匹配度,确定含有缺失数据的物种在谱系种树中的位置;通过自举法,数据重采样得到嫁接物种在谱系树中位置的似然值,完成物种嫁接,构建古生物谱系树。本发明相比最大简约法和属性约简构建谱系树的方法,有效的解决了因大量缺失数据造成的概念样例模板失效以及古生物谱系树难以稳定构建的问题,提高了物种谱系分析的准确率和稳定性。
搜索关键词: 一种 基于 遗传 属性 古生物 谱系 演化 分析 方法
【主权项】:
1.一种基于遗传属性约简的古生物谱系演化分析方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤一,建立一颗谱系种树;步骤二,在所述谱系种树中出现分支的位置建立物种节点,并构造所述谱系种树中每个物种节点的概念样例模板集合;将含有概念样例模板集合的节点作为决策点,建立概念决策种树;步骤三,针对含有缺失数据的物种,从概念决策种树的根决策点出发,通过物种属性与决策点的概念样例模板集合的匹配,对物种进行归属判断;当概念决策种树出现分支时,则判断物种归属于所述分支对应的哪一个子树;归属确定后,从所述物种归属子树的根决策点开始继续进行物种的归属判断;将含有缺失数据的物种嫁接在最终到达的决策点对应的谱系种树的节点上;步骤四,以物种属性的完整程度从高到低的顺序进行嫁接,当所有物种都嫁接完成后,则构建完成了一颗完整的古生物谱系树。
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