[发明专利]药物设计中配体分子特征筛选装置和筛选方法在审
申请号: | 201810173915.0 | 申请日: | 2018-03-02 |
公开(公告)号: | CN108399316A | 公开(公告)日: | 2018-08-14 |
发明(设计)人: | 胡海峰;孙怡 | 申请(专利权)人: | 南京邮电大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 南京苏科专利代理有限责任公司 32102 | 代理人: | 徐振兴;姚姣阳 |
地址: | 210003 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 本发明公开了一种在药物设计中,基于多任务学习的配体分子特征筛选方法及装置。在基于配体的药物分子虚拟筛选中,对于重要的药物靶标,由于发现的配体分子数量很少,很难构建好的虚拟筛选模型。本方法将使用基于LASSO的多任务学习方法,通过任务与任务之间的相关性,利用鲁棒性选择方法得到配体分子相关特征。配体分子的活性通常与少数子结构有关,本方法将快速找到决定主体和配体相互作用活性的关键因素,解决当任务样本量比较少时,模型构造的问题,发现共同的作用因素和各自独特的作用因素,提高模型的鲁棒性,得到与配体活性相关的子结构,进行有效的特征筛选。 | ||
搜索关键词: | 配体分子 特征筛选 任务学习 药物设计 作用因素 子结构 配体 虚拟 筛选 配体相互作用 关键因素 模型构造 筛选模型 药物靶标 药物分子 鲁棒性 样本量 构建 鲁棒 发现 | ||
【主权项】:
1.一种药物设计中配体分子特征筛选方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)获取所需要的初始数据集;(2)配体分子的特征生成;(3)获取各个配体药物靶标作用的活性值;(4)利用多任务学习的方法,进行特征筛选。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于南京邮电大学,未经南京邮电大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/201810173915.0/,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:一种Bcr-Abl蛋白激酶抑制剂的筛选方法
- 下一篇:计费式授权管理方法
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用