[发明专利]一种DNA促旋酶的药物结合口袋及其应用有效
| 申请号： | 201810195616.7 | 申请日： | 2018-03-09 |
| 公开（公告）号： | CN108504647B | 公开（公告）日： | 2021-11-05 |
| 发明（设计）人： | 周晖皓;黄晓杰;郭俊松;顾琼;徐峻 | 申请（专利权）人： | 中山大学 |
| 主分类号： | C12N9/90 | 分类号： | C12N9/90 |
| 代理公司： | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人： | 陈卫 |
| 地址： | 510275 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种DNA促旋酶的药物结合口袋，以DNA促旋酶B亚基的ATP酶结构域为研究对象，利用化合物片段作为探针，通过蛋白质热稳定性迁移实验、ATP酶水解活性实验以及X射线晶体学衍射方法，发现了存在于细菌DNA促旋酶B亚基上一个新型的可药性配体结合口袋；此口袋是在本发明筛选得到的片段探针4‑苯氧基苯酚或4‑4’‑二羟基二苯硫醚的诱导下获得。本发明发现的新型配体结合口袋可以用来设计和筛选具有新结合模式的DNA促旋酶抑制剂；筛选到的化合物片段为新型抗菌药物的设计提供了片段生长、融合和连接的基元。以此新型可药性口袋为起点，将筛选获得的片段与现有抑制剂拼接可以获得高亲和力、高选择性的DNA促旋酶抑制剂并有望克服现有抑制剂的耐药性问题。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 dna 促旋酶 药物 结合 口袋 及其 应用 | ||
【主权项】：
1.一种DNA促旋酶的药物结合口袋，其特征在于，以DNA促旋酶的B亚基为对象，组成所述药物结合口袋的氨基酸残基为Ile78、Ala91、Ile94、Met95、Val120、Leu132、Ile134、Thr165和Val167；同时以共晶结构中4‑苯氧基苯酚或4‑4’‑二羟基二苯硫醚的1’位苯环或1’位苯酚为平面中心，DNA促旋酶B亚基氨基酸残基Ile78侧链逆时针翻转90°，Met95侧链向后翻转60°以及Leu132侧链顺时针翻转90°形成。
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