[发明专利]一种整合图像空间信息的基于体素点全基因组关联分析方法在审
| 申请号： | 201810200077.1 | 申请日： | 2018-03-12 |
| 公开（公告）号： | CN108345769A | 公开（公告）日： | 2018-07-31 |
| 发明（设计）人： | 黄美燕;冯前进;邓春燕;阳维 | 申请（专利权）人： | 南方医科大学 |
| 主分类号： | G06F19/22 | 分类号： | G06F19/22;G06F19/18;G06T7/00 |
| 代理公司： | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人： | 赵蕊红 |
| 地址： | 510515 广东省广州市*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 一种整合图像空间信息的基于体素点全基因组关联分析方法，包括以下步骤：(1)收集图像数据和基因数据；(2)整合图像数据的空间信息，对目标对象的图像数据进行处理获得整合了图像空间信息的图像数据：(3)对基因数据和图像数据进行FVGWAS分析。该整合图像空间信息的基于体素点全基因组关联分析方法，由于个体本身固有的生物结构和功能，图像数据具有空间结构相关性，这些空间结构包含了大量的重要信息，把这些信息整合到VGWAS方法。具有检测性能力强，精度高，计算简单的特点。 | ||
| 搜索关键词： | 图像数据 整合 图像空间 关联分析 全基因组 空间结构 体素 基因数据 空间信息 目标对象 生物结构 信息整合 重要信息 性能力 检测 分析 | ||
【主权项】：
1.一种整合图像空间信息的基于体素点全基因组关联分析方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)收集图像数据和基因数据；(2)整合图像数据的空间信息：即对目标对象的图像数据进行平滑处理获得整合了图像空间信息的图像数据；(3)对基因数据和图像数据进行FVGWAS分析，具体包括，(3.1)对图像数据和基因数据构建回归模型，对给定的显型使用检验统计的方法来检验每个位点上无关联的空假设；(3.2)对所有基因数据，计算全局Wald型检验，然后对全局Wald型检验的p值进行排序，选出前N0个位点作为候选显著关联位点，以筛掉含“噪声”的位点，N0为自然数；(3.3)执行基于bootstrap的检测过程，分别用来检测显著的基因‑体素点对和显著的基因‑团对。
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G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
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G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
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