[发明专利]一种预测LncRNA和环境因素关联关系的方法有效
| 申请号： | 201810209311.7 | 申请日： | 2018-03-14 |
| 公开（公告）号： | CN108427865B | 公开（公告）日： | 2022-04-22 |
| 发明（设计）人： | 周杰;徐展良 | 申请（专利权）人： | 华南理工大学 |
| 主分类号： | G16B40/20 | 分类号： | G16B40/20;G16B50/30;G16B20/00 |
| 代理公司： | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人： | 李斌 |
| 地址： | 510640 广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种预测LncRNA和环境因素关联关系的方法，包括：S1、根据已知的LncRNA‑环境因素关联关系网络的邻接矩阵，分别计算出LncRNA的高斯相互作用属性核相似矩阵KL和环境因素的高斯相互作用属性核相似矩阵KE；S2、把KL和KE通过拉普拉斯算子进行归一化；S3、在LncRNA空间和环境因素空间中分别定义成本函数，通过最小化该成本函数，分别得到LncRNA空间和环境因素空间的最优分类器；S4、将得到的两种最优分类器转化为统一空间的分类器，用于计算LncRNA‑环境因素关联关系的概率，根据概率对LncRNA‑环境因素关联关系进行排名，概率值越高说明该LncRNA‑环境因素的关联关系越强。所述方法有效解决了生物实验方法的盲目性、成本高问题，对生物学家的实验研究起到了指导的作用。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 预测 lncrna 环境 因素 关联 关系 方法 | ||
【主权项】：
1.一种预测LncRNA和环境因素关联关系的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：S1、根据已知的LncRNA‑环境因素关联关系网络的邻接矩阵，分别计算出LncRNA的高斯相互作用属性核相似矩阵KL和环境因素的高斯相互作用属性核相似矩阵KE；S2、把LncRNA的高斯相互作用属性核相似矩阵KL和环境因素的高斯相互作用属性核相似矩阵KE通过拉普拉斯算子进行归一化；S3、在LncRNA空间和环境因素空间中分别定义成本函数，通过最小化该成本函数，分别得到LncRNA空间和环境因素空间的最优分类器；S4、将步骤S3得到的两种最优分类器转化为统一空间的分类器，用于计算LncRNA‑环境因素关联关系的概率，根据概率对LncRNA‑环境因素关联关系进行排名，概率值越高说明该LncRNA‑环境因素的关联关系越强。
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