[发明专利]基于KRAS和NDRG4基因以及血红蛋白确定结直肠肿瘤细胞的方法和系统有效
申请号: | 201810271406.1 | 申请日: | 2018-03-29 |
公开(公告)号: | CN108486237B | 公开(公告)日: | 2022-05-03 |
发明(设计)人: | 毛瑞芳;陈璟;王云霞;王君;秦楠 | 申请(专利权)人: | 上海锐翌生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/6886;G01N33/72 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵天月 |
地址: | 201114 上海市闵行区*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明提出了检测SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列的第12密码子和第13密码子突变的试剂、检测SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列的第6和第10个CpG位置的基因甲基化连锁水平的试剂和检测血红蛋白的试剂在制备确定结直肠肿瘤细胞的试剂中的用途和系统,所述制备确定结直肠肿瘤细胞的试剂的使用方法包括:基于所述KRAS基因突变率、NDRG4基因甲基化连锁比率以及血红蛋白检测结果,确定所述待测样本是否存在结直肠肿瘤细胞。利用本发明的试剂及系统能够快速、简单且特异性检测出是否为结直肠肿瘤细胞,且灵敏度高。 | ||
搜索关键词: | 基于 kras ndrg4 基因 以及 血红蛋白 确定 直肠 肿瘤 细胞 方法 系统 | ||
【主权项】:
1.一种确定结直肠肿瘤细胞的方法,其特征在于,包括:分别获得待测样本的KRAS基因和NDRG4基因,并将所述NDRG4基因进行甲基化处理;分别对所述KRAS基因和经甲基化处理的NDRG4基因进行测序,获得KRAS基因测序结果和NDRG4基因测序结果;将所述KRAS基因测序结果中第一目标靶点位置的基因序列与第一参考序列进行第一比对,计算出KRAS基因突变率;将所述NDRG4基因测序结果中第二目标靶点位置的基因序列与第二参考序列进行第二比对,计算出NDRG4基因甲基化连锁比率;对所述待测样本进行血红蛋白检测;基于所述KRAS基因突变率、NDRG4基因甲基化连锁比率以及血红蛋白检测结果,确定所述待测样本是否存在结直肠肿瘤细胞。
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