[发明专利]基于转录组学链霉菌次级代谢强启动子挖掘方法及应用有效
申请号: | 201810288604.9 | 申请日: | 2018-04-03 |
公开(公告)号: | CN108490193B | 公开(公告)日: | 2019-07-16 |
发明(设计)人: | 李永泉;毛旭明;王凯;郑洋;卜庆廷 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 赵杭丽 |
地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开一种基于转录组学链霉菌次级代谢强启动子挖掘方法及应用,是通过比较分析链霉菌转录组基因芯片数据,筛选次级代谢中表达水平相对提高明显的基因,并扩增这些基因的启动子区域,作备选启动子。以强启动子ermE*p作参照,利用egfp报告基因表征备选启动子活性,确证启动子在次级代谢中相对高活性。此外,与ermE*p相比,应用筛选得到的启动子高表达恰塔努加链霉菌纳他霉素途径特异性正调控因子,使纳他霉素产量提高30%。本发明方法可应用于链霉菌次级代谢基因表达调控。 | ||
搜索关键词: | 次级代谢 链霉菌 强启动子 启动子 转录组 纳他霉素 应用 备选 恰塔努加链霉菌 筛选 基因表达调控 基因芯片数据 启动子活性 启动子区域 比较分析 表达水平 调控因子 高表达 高活性 基因 挖掘 扩增 | ||
【主权项】:
1.基于转录组学链霉菌次级代谢强启动子挖掘方法,其特征是,通过比较分析链霉菌转录组基因芯片数据,筛选出次级代谢中表达水平相对提高明显的基因,并扩增出这些基因的启动子区域,作为备选启动子,利用egfp报告基因次级代谢中表达水平进一步确认和表征备选启动子活性,同时以强启动子ermE*p作为参照,确证启动子在初级代谢中低活性但在次级代谢中高活性。
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