[发明专利]一种基因序列数据处理方法、装置及系统在审
| 申请号： | 201810296700.8 | 申请日： | 2018-04-03 |
| 公开（公告）号： | CN108537006A | 公开（公告）日： | 2018-09-14 |
| 发明（设计）人： | 朱红 | 申请（专利权）人： | 郑州云海信息技术有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/20 | 分类号： | G06F19/20;G06F19/28 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 450018 河南省郑州市*** | 国省代码： | 河南;41 |
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| 摘要： | 本申请实施例公开了一种基因序列数据处理方法、装置及系统，所述方法包括根据设定的拆分规则，对参考基因序列进行拆分，获得M组参考基因子序列；生成M个程序运行脚本，将所述M个程序运行脚本投递到所述多节点计算机集群的作业调度系统中进行计算，获得M个基因序列处理子结果，其中，每个程序运行脚本运行结束后输出一个相应的基因序列处理子结果；对所述M个基因序列处理子结果进行汇总，获得基因序列数据处理结果。有益效果：1、利用集群资源多节点并行处理基因数据，从而缩短数据处理时间；2、本申请并不涉及修改软件源代码，易于实现；3、没有太大的操作系统/软硬件环境依赖，可以适配于各种计算机集群和各种作业调度系统。 | ||
| 搜索关键词： | 基因序列 程序运行 数据处理 子结果 作业调度系统 装置及系统 脚本 源代码 参考基因序列 多节点计算机 数据处理结果 计算机集群 软硬件环境 并行处理 基因数据 集群资源 脚本运行 修改软件 因子序列 多节点 集群 适配 操作系统 申请 投递 参考 输出 | ||
【主权项】：
1.一种基因序列数据处理方法，其特征在于，应用于多节点计算机集群，所述方法包括：根据设定的拆分规则，对参考基因序列进行拆分，获得M组参考基因子序列；生成M个程序运行脚本，将所述M个程序运行脚本投递到所述多节点计算机集群的作业调度系统中进行计算，获得M个基因序列处理子结果，其中，每个程序运行脚本运行结束后输出一个相应的基因序列处理子结果；对所述M个基因序列处理子结果进行汇总，获得基因序列数据处理结果。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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