[发明专利]一种基于新标记模式的生物医学事件联合抽取方法有效

专利信息
申请号: 201810375882.8 申请日: 2018-04-17
公开(公告)号: CN108628970B 公开(公告)日: 2021-06-18
发明(设计)人: 李丽双;马玉柯;刘阳;钱爽 申请(专利权)人: 大连理工大学
主分类号: G06F16/332 分类号: G06F16/332;G06F40/284;G06F16/36;G06K9/62;G16H15/00
代理公司: 大连理工大学专利中心 21200 代理人: 温福雪;侯明远
地址: 116024 辽*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要: 发明属于自然语言处理技术领域,涉及一种基于新标记模式的生物医学事件联合抽取方法。本发明包括生物医学事件联合抽取过程中触发词和要素的新标记方法、基于LSTM深度学习网络进行触发词和要素的同时识别、以及基于SVM分类器处理生成事件的生物医学事件联合抽取方法。使本发明可以从原始的生物医学语料中抽取出已定义的9类生物医学事件,抽取过程结合深度学习的方法,减少了人工进行特征选取的工作;本发明为生物医学事件联合抽取提供一种新的触发词和要素的标记方法。
搜索关键词: 一种 基于 标记 模式 生物医学 事件 联合 抽取 方法
【主权项】:
1.一种基于新标记模式的生物医学事件联合抽取方法,其特征在于,所述的基于新标记模式的生物医学事件联合抽取方法采用的标注方式如下:根据语句中实体的种类数,使用含有四个字段的四元组{1‑2‑3‑4}对实体进行标注;其中,1、2、3字段为基础字段,是标注事件所需要的最少字段;4字段为可选字段,当且仅当语句中包含复杂事件时用到,复杂事件包括嵌套事件和交叉事件;该四元组中每个字段的取值及具体含义如下表1:表1 标注方式具体步骤如下:(1)原始语料预处理A.分词和依存解析分词是指将原始语料进行单词切分;分词后再通过依存解析获取语言单位内各成分之间的依存关系,揭示其句法结构,同时获取依存上下文用以训练基于依存关系的词向量;B.词向量表示采用word2vecf,利用依存上下文信息进行词向量训练,得到最终的句法词向量矩阵;(2)训练集标注对于训练集中已经明确的触发词、要素、事件类型,利用上述的标记方式对训练集中的词向量进行标记,得到训练集;(3)训练神经网络建立LSTM神经网络并将训练集代入进行训练,得到基于LSTM神经网络的生物事件抽取模型;(4)对测试集进行分类得到训练的LSTM神经网络后,将测试集代入,LSTM神经网络对测试集中的单词分类后,得到测试集每个句子中每个单词的标记结果,标记结果代表单词是否与构成事件有关、是否是触发词或要素以及所属的事件类型;(5)SVM分类器处理生成事件训练出实体的标记结果之后,得到了事件语义图中孤立的节点和边;首先,按照生物医学事件的约束进行组合构成合理的事件候选;然后,采用统计机器学习中的SVM的方法,判断该事件候选是否为事件;完成上述事件抽取步骤后,最终即得到一个包含触发词、事件类型、要素三个元素的三元组,该三元组即表示一个完整的生物医学事件。
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