[发明专利]检测染色体非整倍性的方法、装置及系统在审
申请号: | 201810425695.6 | 申请日: | 2018-05-07 |
公开(公告)号: | CN108629152A | 公开(公告)日: | 2018-10-09 |
发明(设计)人: | 曾立董;吴增丁;金欢;徐伟彬;李林森;赵陆洋;张萌;颜钦 | 申请(专利权)人: | 深圳市瀚海基因生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18;G06F19/20;G06F19/28;C12M1/34;C12Q1/6869 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 518004 广东省深圳市:罗湖区莲*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种检测染色体非整倍性的方法、装置及系统。方法包括:对待测样本中的至少一部分核酸进行测序,获得包括读段的测序结果;将读段比对到第一参考序列,获得比对结果,比对结果包括读段定位于具体染色体的信息;对于第一染色体,基于比对结果,确定定位到该第一染色体的读段的量;比较定位到该第一染色体的读段的量与阴性样本中的定位到相应第一染色体的读段的量,以判定该第一染色体的数目。利用该方法进行染色体非整倍性检测,获得的检测结果具有较高灵敏度和准确性。 | ||
搜索关键词: | 染色体 比对结果 染色体非整倍性 装置及系统 测序 检测染色体 参考序列 非整倍性 高灵敏度 检测结果 阴性样本 种检测 核酸 比对 样本 判定 检测 | ||
【主权项】:
1.一种检测染色体非整倍性的方法,其特征在于,包括:(1)对待测样本中的至少一部分核酸进行测序,获得包括读段的测序结果;(2)将所述读段比对到第一参考序列,获得比对结果,所述比对结果包括所述读段定位于具体染色体的信息,所述第一参考序列为参考基因组上的比对能力为1的区域的集合,比对能力为1的区域为定位到所述参考基因组上唯一位置的区域;(3)对于第一染色体,基于所述比对结果,确定定位到该第一染色体的读段的量;(4)比较所述定位到该第一染色体的读段的量与阴性样本中的定位到相应第一染色体的读段的量,以判定该第一染色体的数目。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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