[发明专利]一种可直接用于高通量测序的植物细胞器DNA提取方法在审

专利信息
申请号: 201810446106.2 申请日: 2018-05-11
公开(公告)号: CN108410860A 公开(公告)日: 2018-08-17
发明(设计)人: 不公告发明人 申请(专利权)人: 江苏省中国科学院植物研究所
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 210014 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种可直接用于高通量测序的植物细胞器DNA提取方法。首先配置GM1(含BSA,PVP,β‑巯基乙醇),GM2(含BSA,β‑巯基乙醇),GM3(含BSA);然后将将新鲜植物材料进行预处理后,加入GM1研磨缓冲液,研磨过滤后收集滤液,对滤液进行离心,得到线粒体与叶绿体的粗提物;加入GM2进行悬浮后,清洗,离心得到较纯的线粒体与叶绿体;加入GM3悬浮后,加入DNaseⅠ降解核DNA,离心后收集线粒体与叶绿体,使用试剂盒提取细胞器DNA。本发明能够快速获得可以用于二代或三代测序的植物细胞器DNA。
搜索关键词: 细胞器DNA 线粒体 叶绿体 高通量测序 巯基乙醇 悬浮 预处理 研磨缓冲液 新鲜植物 研磨 粗提物 试剂盒 核DNA 测序 降解 过滤 清洗 配置
【主权项】:
1.一种可直接用于高通量测序的植物细胞器DNA提取方法,其特征是,具体包括下述步骤,下述(3)‑(6)均在4℃进行操作:(1)缓冲液配置:GM1缓冲液:0.5 M蔗糖,0.001M EDTA,0.1M KH2PO4,1% BSA,0.5%PVP,1%β‑巯基乙醇,pH 7.5;GM2缓冲液:0.5 M蔗糖,0.001M EDTA,0.1M KH2PO4,1% BSA,1%β‑巯基乙醇,pH 7.5;GM3缓冲液:0.5 M蔗糖,0.001M EDTA,0.1M KH2PO4,1% BSA,pH 7.5;(2)材料预处理:取新鲜植物材料清洗后在4℃预冷1h;(3)破碎细胞:将步骤(2)中的材料放置于粉碎机中,加入步骤(1)中的GM1,打磨2min;8层纱布过滤,获得上清液;(4)分离细胞器:将步骤(3)中获得的上清液,1 800g 离心5min,取上清;2 000g 离心5min,取上清;4 000g 离心10min,取上清;18 000g 离心20min,收集沉淀;(5)纯化细胞器:将步骤(4)中获得的沉淀,加入步骤(3)中的GM2,悬浮沉淀后,2 000g 离心5min,取上清;4 000g 离心10min,取上清;18 000g 离心20min,收集沉淀;(6)降解核DNA:将步骤(5)中获得的沉淀加入步骤(1)中的GM3悬浮后,加入DNaseⅠ,置于冰上2h后,18 000g 离心20min,收集沉淀;(7)提取细胞器DNA:利用试剂盒提取细胞器DNA。
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