[发明专利]基于SAT及OBDD桶消元的蛋白质分类方法在审
申请号: | 201810463426.9 | 申请日: | 2018-05-15 |
公开(公告)号: | CN108664768A | 公开(公告)日: | 2018-10-16 |
发明(设计)人: | 徐周波;戴瑀君;梁轩瑜;宁黎华;刘桂珍;张鵾;杨健;黄文文 | 申请(专利权)人: | 桂林电子科技大学 |
主分类号: | G06F19/24 | 分类号: | G06F19/24 |
代理公司: | 桂林市持衡专利商标事务所有限公司 45107 | 代理人: | 陈跃琳 |
地址: | 541004 广西*** | 国省代码: | 广西;45 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 本发明公开一种基于SAT及OBDD桶消元的蛋白质分类方法,其采用布尔可满足性问题(SAT)的模型,利用有序二叉决策图(OBDD)的符号求解算法以及桶消元算法,包括:先利用候选模式中元素位置的约束关系以及基数约束构建SAT模型;再使用OBDD符号技术以及包含的各项符号操作,结合桶消元算法,对所建立的模型进行求解,并且将求解技术应用到蛋白质分类中,分析提取了蛋白质中的特征信息,进行有效的分类。本发明面向蛋白质分类问题,通过求解模式挖掘中的频繁序列挖掘问题,对蛋白质进行研究。算法执行过程中,有效缩减了搜索空间,提高问题的求解效率,具有良好的实用性。 | ||
搜索关键词: | 蛋白质分类 求解 算法 蛋白质 布尔可满足性问题 符号操作 符号技术 候选模式 基数约束 技术应用 模式挖掘 频繁序列 求解算法 求解效率 搜索空间 算法执行 特征信息 元素位置 约束关系 决策图 再使用 构建 分类 挖掘 分析 研究 | ||
【主权项】:
1.基于SAT及OBDD桶消元的蛋白质分类方法,其特征是,具体包括步骤如下:步骤1、根据给定的蛋白质序列以及最小支持度阈值,使用命题变量来表示候选模式中元素的位置,使用基数约束推导候选模式的支持度,建立蛋白质分类的SAT模型;步骤2、将步骤1所建立的SAT模型的所有约束子句转化为布尔函数表述形式,并运用OBDD的运算和化简规则,将所有约束子句表示为OBDD形式,得到SAT模型的符号OBDD表示;步骤3、根据步骤2所得的SAT模型的符号OBDD表示,在桶消元算法的基础上,通过OBDD的符号操作来求解SAT。
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