[发明专利]用于基因组组装及单体型定相的方法有效
| 申请号： | 201810469575.6 | 申请日： | 2014-01-31 |
| 公开（公告）号： | CN108624668B | 公开（公告）日： | 2022-12-02 |
| 发明（设计）人： | 小R·E·格林;L·F·拉里奥 | 申请（专利权）人： | 加利福尼亚大学董事会 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;G16B25/20;G16B30/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 | 代理人： | 杨淑媛 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 本发明提供了用于大大加快并改善从头基因组组装的方法。本文所公开的方法利用数据分析方法，使来自一个或多个受试者的基因组的从头组装快速且便宜。本发明进一步提供，本文所公开的方法可用于多种应用，包括单体型定相和宏基因组分析。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 基因组 组装 体型 方法 | ||
【主权项】：
1.一种用于基因组组装的方法，其包括：生成多个重叠群；从通过探测染色体、染色质或重构染色质的物理布局产生的数据中，生成多个读对；将所述多个读对定位或组装至所述多个重叠群；使用读段定位或组装数据，构建重叠群的邻接矩阵；分析所述邻接矩阵，以确定经过所述重叠群的路径，所述路径代表所述重叠群的次序和/朝着基因组的方向。
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