[发明专利]测序建库的引物序列处理方法、装置、设备及存储介质有效
| 申请号： | 201810490410.7 | 申请日： | 2018-05-21 |
| 公开（公告）号： | CN108664767B | 公开（公告）日： | 2020-01-31 |
| 发明（设计）人： | 刘晶星;毛琳琳;严慧;赵薇薇;于世辉 | 申请（专利权）人： | 广州金域医学检验中心有限公司;广州金域医学检验集团股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10 |
| 代理公司： | 44224 广州华进联合专利商标代理有限公司 | 代理人： | 林青中 |
| 地址： | 510005 广东省广州市开发*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种测序建库的引物序列处理方法、装置、设备及存储介质。该方法包括获取将测序数据比对到参考基因组得到的测序比对文件、从所述测序比对文件得到正向比对结果和反向比对结果、确定正向比对结果中的各read对应的扩增子，以及确定反向比对结果中的各read对应的扩增子等步骤。该测序建库的引物序列处理方法、装置、设备和存储介质通过对测序结果进行处理，可以精准识别扩增片段中的引物部分，经过后续处理，如软切或硬切，可以排除该引物部分对测序结果分析的影响，可以最大限度的保留待测序片段的数据信息，保证测序结果分析的准确性和可靠性。 | ||
| 搜索关键词： | 测序 比对结果 存储介质 引物序列 比对 建库 结果分析 扩增子 引物 正向 测序片段 测序数据 后续处理 扩增片段 数据信息 基因组 参考 保留 保证 | ||
【主权项】：
1.一种测序建库的引物序列处理方法，其特征在于，包括如下步骤：/n获取将测序数据比对到参考基因组得到的测序比对文件；/n从所述测序比对文件得到正向比对结果和反向比对结果；/n对所述正向比对结果中的各read，从起始位置大于当前read的原始比对起始位置的所有扩增子中，确定起始位置最接近当前read的原始比对起始位置的扩增子作为与当前read对应的扩增子，得到正向比对结果中各read对应的扩增子；/n将正向比对的各read的比对起始位置由其原始比对起始位置重新确定为与各read对应的扩增子的起始位置；/n对正向比对的各read的原始比对起始位置与与其对应的扩增子的起始位置之间的序列部分按照如下三种方式中的一种进行处理：1、软切，2、硬切，3、提取出原始序列数据后，在原始序列数据中切除该序列部分的序列数据；/n对所述反向比对结果中的各read，从终止位置小于当前read的原始比对终止位置的所有扩增子中，确定终止位置最接近当前read的原始比对终止位置的扩增子作为与当前read对应的扩增子，得到反向比对结果中各read对应的扩增子；/n将反向比对的与各read对应的配对read的比对起始位置由其原始比对起始位置重新确定为与各read对应的扩增子的起始位置；/n对反向比对的各read的原始比对终止位置与与其对应的扩增子的终止位置之间的序列部分按照如下三种方式中的一种进行处理：1、软切，2、硬切，3、提取出原始序列数据后，在原始序列数据中切除该序列部分的序列数据。/n
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