[发明专利]鸡MHC B-F座位全序列测定和SNP检测方法、引物及试剂盒

摘要

本发明属于生物技术领域，尤其涉及鸡MHC B‑F座位全序列测定和SNP检测方法、引物、试剂盒。引物，SEQ ID NO 1‑34。检测方法：（1）引物设计：特异性引物包括SEQ ID NO 1‑34；（2）DNA提取；（3）特异引物单重质控、多重PCR引物调整；（4）琼脂糖胶电泳检测；（5） DNA文库的制备；（6）Miseq测序；（7）SNP检测；（8）群体遗传多样性分析。试剂盒，包括17对多重PCR特异性引物信息SEQ ID NO 1‑34，灭菌双蒸水，dNTP，Taq酶，PCR扩增缓冲液。本发明为测定鸡MHC B‑F1和B‑F2座位基因全序列，分析鸡MHC B‑F座位遗传多样性提供了技术平台。

主权项

1.鸡MHC B‑F座位全序列测定和SNP检测用引物，包括以下17对引物，具体为：BF1‑1F：GACTGGTCCCAGAACGTG(SEQ ID NO 1)R：ATCTGCGTCTGTCCATCC(SEQ ID NO 2)BF1‑2F：TGCACTACAACAGCACCG(SEQ ID NO 3)R：CACAGCCGAACATCCACT(SEQ ID NO 4)BF1‑3F：AGGAACGATACAACCAGACC(SEQ ID NO 5)R：ATTTCCTCTTGGTGGGAACT(SEQ ID NO 6)BF1‑4F：GAAAGACTTCATTGCCTTCG(SEQ ID NO 7)R：GTCCTTCAGCCAGCTGAC(SEQ ID NO 8)BF1‑5F：GGATCCTGACCTTGTCCTG(SEQ ID NO 9)R：CGTGGCGTCTGTAGATGAT(SEQ ID NO10)BF1‑6F：GGGTGAGTGAGGGGATGT(SEQ ID NO 11)R：AATGGGTACCCTGGGAGA(SEQ ID NO 12)BF1‑7F：GTGAGTGATGAGGGCAGC(SEQ ID NO 13)R：TGCTGGTGTGGACTGTTG(SEQ ID NO 14)BF1‑8F：CTCTTCTCATCCCCACAGG(SEQ ID NO 15)R：GAGTTCTGCCAGGACAGG(SEQ ID NO 16)BF1‑9F：CGTTCCTTCTCACCTCTCC(SEQ ID NO 17)R：AAACCAGGAGACGGCTAGA(SEQ ID NO 18)BF1‑10F：AGCTCTCCTGTCCCTGCT(SEQ ID NO 19)R：TACCGCTGCTGTACGACA(SEQ ID NO 20)BF2‑1F：CGGAGGAGTAGGAAAAGCT(SEQ ID NO 21)R：CAGTACTGCTGGTCCGTG(SEQ ID NO 22)BF2‑2F：CACTACAACAGCACCGCT(SEQ ID NO 23)R：AGACCCTGAAACACAGCC(SEQ ID NO 24)BF2‑3F：AACCTGGACATACTGCGG(SEQ ID NO 25)R：AACTGCCTCTGGAACTGC(SEQ ID NO 26)BF2‑4F：ACGATGGGAGAGACTTCG(SEQ ID NO 27)R：GTCCTTCAGCCAGCTGAC(SEQ ID NO 28)BF2‑5F：ATCCTGACCTTGTCCTGC(SEQ ID NO 29)R：CCCCTCTGCTTTTACCTG(SEQ ID NO 30)BF2‑6F：GTGGTTGGTGTTGGATTCA(SEQ ID NO 31)R：GTACCACCGAGAGCACATG(SEQ ID NO 32)BF2‑7F：GACAGGGAAGGTGGATCC(SEQ ID NO 33)R：ACCACAGCACAGTGCAGA(SEQ ID NO 34)。