[发明专利]一种基因分类方法及相关设备在审
| 申请号： | 201810522807.X | 申请日： | 2018-05-28 |
| 公开（公告）号： | CN108763873A | 公开（公告）日： | 2018-11-06 |
| 发明（设计）人： | 张莉;黄晓娟;王邦军;张召;李凡长 | 申请（专利权）人： | 苏州大学 |
| 主分类号： | G06F19/24 | 分类号： | G06F19/24 |
| 代理公司： | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人： | 罗满 |
| 地址： | 215137 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种基因分类方法及相关设备，方法包括：对输入的作为训练样本的基因数据进行标准化处理，基因数据包括若干属性；以训练样本与异类近邻样本的间隔与训练样本与同类近邻样本的间隔的差值，以及对应属性的权重向量建立表示所有训练样本的期望间隔差的逻辑回归优化函数，并以对应属性的权重向量为范数约束项建立最小化优化模型，通过迭代运算计算得到对应属性的权重向量；根据得到的权重向量的值对属性特征排序，根据排序后的属性特征对作为训练样本的基因数据进行分类训练，获得作为分类根据的最优特征集，以对待分类基因数据进行分类。本发明提供的基因分类方法及相关设备，能够获得较高的分类精度。 | ||
| 搜索关键词： | 训练样本 基因数据 权重向量 基因分类 分类 属性特征 排序 样本 标准化处理 迭代运算 逻辑回归 期望间隔 优化函数 优化模型 异类 特征集 约束项 最小化 范数 | ||
【主权项】：
1.一种基因分类方法，其特征在于，包括：对输入的作为训练样本的基因数据进行标准化处理，所述基因数据包括若干属性；以训练样本与异类近邻样本的间隔与训练样本与同类近邻样本的间隔的差值，以及对应属性的权重向量建立表示所有训练样本的期望间隔差的逻辑回归优化函数，并以对应属性的权重向量为范数约束项建立最小化优化模型，通过迭代运算计算得到对应属性的权重向量；根据得到的权重向量的值对属性特征排序，根据排序后的属性特征对作为训练样本的基因数据进行分类训练，获得作为分类根据的最优特征集，以对待分类基因数据进行分类。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于苏州大学，未经苏州大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201810522807.X/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
