[发明专利]一种基于全基因组信息学分析定向筛选角鲨烯菌株的方法有效
申请号: | 201810535693.2 | 申请日: | 2018-05-30 |
公开(公告)号: | CN108753616B | 公开(公告)日: | 2021-11-26 |
发明(设计)人: | 杨帆;刘延峰;陈良强;胡光源;林琳;王和玉;王莉;陈坚 | 申请(专利权)人: | 贵州茅台酒股份有限公司 |
主分类号: | C12N1/02 | 分类号: | C12N1/02;C12P5/02;G16B30/00;G16B50/00;C12R1/645 |
代理公司: | 北京市万慧达律师事务所 11111 | 代理人: | 谢敏楠 |
地址: | 564501*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | 本发明属于生物工程技术领域,涉及一种基于全基因组结合生物信息学定向筛选产目标产物菌株的方法,尤其是一种基于全基因组结合生物信息学定向筛选产角鲨烯菌株的方法。本发明基于生物信息学的方法,对角鲨烯的合成代谢途径及关键基因进行分析,根据已测序完成的微生物全基因组数据,获得具有产角鲨烯的代谢途径和潜在能力的菌株;然后根据其代谢途径的类别、关键酶特性和底物要求,针对性的设计和优化发酵培养基和发酵条件,从而定向筛选获得产角鲨烯的目标菌株。最终获得了酱香型白酒酿造过程中具有产角鲨烯能力的粟酒裂殖酵母。本发明可高效、定向筛选产角鲨烯菌株,对其它目标产物的筛选也同样具有重要的指导和应用价值。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 基因组 信息学 分析 定向 筛选 角鲨烯 菌株 方法 | ||
【主权项】:
1.一种定向筛选产角鲨烯菌株的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)基于酒醅样品中微生物的全基因组序列数据,对基因预测和功能注释,得到基因注释集合;(2)基于数据库收集角鲨烯合成的代谢通路信息;(3)将(2)中找到的信息与(1)中的基因注释集合进行比对,获得具有角鲨烯合成代谢通路或角鲨烯合成代谢通路关键酶的候选菌株;(4)根据(3)中候选菌株产角鲨烯代谢通路类型、关键酶和底物,设计候选菌株的培养基、优化发酵培养基和发酵条件,筛选出目标菌株。
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