[发明专利]通过单核苷酸多态性预测褐飞虱群体对抗虫水稻品种IR36致害力水平的方法有效
申请号: | 201810540995.9 | 申请日: | 2018-05-30 |
公开(公告)号: | CN108707674B | 公开(公告)日: | 2021-08-03 |
发明(设计)人: | 庞锐;张文庆;陈孟;袁龙宇 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858 |
代理公司: | 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 | 代理人: | 刘婉 |
地址: | 510275 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提供了一种通过单核苷酸多态性预测褐飞虱群体对抗虫水稻品种IR36致害力水平的方法,其包括以下步骤:抽提单头褐飞虱基因组DNA;PCR扩增褐飞虱烟碱乙酰胆碱受体α结构域‑7基因片段;对PCR产物进行测序,获得褐飞虱个体相应SNP的基因型:若目标SNP位点251576和251580基因型为GA,则褐飞虱个体基因型为致害基因型;若所述目标SNP位点基因型为TT,则褐飞虱个体基因型为非致害基因型;将获得的SNP信息进行统计并预测褐飞虱群体的致害力:统计褐飞虱群体中所述目标SNP位点的致害基因型和非致害基因型的分布情况,致害基因型所占比例越大,群体致害力越高,反之则群体致害力越低。本发明能够有效、准确地预测褐飞虱群体对抗虫水稻品种IR36致害力水平。 | ||
搜索关键词: | 通过 核苷酸 多态性 预测 褐飞虱 群体 对抗 水稻 品种 ir36 致害力 水平 方法 | ||
【主权项】:
1.一种通过单核苷酸多态性预测褐飞虱群体对抗虫水稻品种IR36致害力水平的方法,其包括以下步骤:(1)抽提单头褐飞虱基因组DNA;(2)PCR扩增褐飞虱烟碱乙酰胆碱受体α结构域‑7基因片段;(3)对PCR产物进行测序,获得褐飞虱个体相应SNP的基因型:若目标SNP位点251576和251580的基因型为GA,则褐飞虱个体基因型为致害基因型;若所述目标SNP位点的基因型为TT,则褐飞虱个体基因型为非致害基因型;(4)将获得的SNP信息进行统计并预测褐飞虱群体的致害力:统计褐飞虱群体中所述目标SNP位点的致害基因型和非致害基因型的分布情况,致害基因型所占比例越大,群体致害力越高,反之则群体致害力越低。
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