[发明专利]可包含人造碱基的DNA存储分层表示与交织编码方法有效
申请号: | 201810573636.3 | 申请日: | 2018-06-06 |
公开(公告)号: | CN110569974B | 公开(公告)日: | 2021-08-24 |
发明(设计)人: | 陈为刚;韩昌彩 | 申请(专利权)人: | 天津大学 |
主分类号: | G06N3/12 | 分类号: | G06N3/12;H03M13/27 |
代理公司: | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人: | 李林娟 |
地址: | 300072*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | 本发明公开了可包含人造碱基的DNA存储分层表示与交织编码方法,属于DNA存储可靠编码领域,本发明将二进制数据加扰、分组纠错码后分为若干子块,来自不同编码子块按分层方式组成寡核苷酸分子,当分子丢失或碱基发生错误时,错误会被分散到多个纠错码纠错;采用围长大的二部图实现分层与分组码的对应,可实现很多寡核苷酸分子组成整体,提高纠错能力与DNA存储的可靠性。进一步,包含人造碱基对,增大单碱基的存储容量,也可将每个分子分解为更多层,改善纠错性能与存储效率。本发明的优势在于,可包含人造碱基,提高单碱基存储密度;通过分层与基于二部图的交织保证存储可靠性;提供了一种高可靠性、高密度的DNA存储编码方法。 | ||
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【主权项】:
1.可包含人造碱基的DNA存储分层表示与交织编码方法,其特征在于,所述编码方法包含下述步骤:/n(1)将用户二进制比特数据先进行扰码,然后进行纠错编码,得到一系列固定长度的分组纠错码;/n(2)将每一分组纠错码包含的N比特平均分成n个子分组,每个子分组包含的比特数目为N/n,其中n为正整数,是N的因子,N/n也为整数;/n(3)根据采用的管核苷酸合成、测序与扩增所用的生化技术方法,确定可用的寡核苷酸的碱基集合,集合大小用正整数b表示;/n(4)选择N/n个碱基组成一个分组,将每个碱基映射为k个比特{b
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