[发明专利]大熊猫微卫星多态位点、鉴定方法和引物序列

摘要

本发明公开了大熊猫微卫星多态位点、鉴定方法和引物序列。本发明筛选出的21对大熊猫微卫星多态位点特异引物序列，其序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.42所示。鉴定大熊猫微卫星多态位点的方法利用大熊猫基因组筛选出微卫星位点并设计高质量引物；将大熊猫基因组测序read数据比对到大熊猫参考基因组鉴定INDEL，将INDEL鉴定结果与微卫星位点筛选结合，筛选出具有多态性的微卫星位点及高质量引物。本发明所提供的21对微卫星引物，均为多态性位点，具有较强的分辨能力。利用这套微卫星引物，可经济、快速、正确地进行大熊猫个体鉴定和亲子关系鉴定，有助于对大熊猫种群进行家族谱系重建和信息完善，为制定科学的大熊猫保护方案提供数据支持。

主权项

1.一种大熊猫微卫星多态位点的扩增引物对组合物，其特征在于包括下述21对引物对，引物对的引物序列如下：引物对一：上游引物如SEQ ID NO.1所示；下游引物如SEQ ID NO.2所示；引物对二：上游引物如SEQ ID NO.3所示；下游引物如SEQ ID NO.4所示；引物对三：上游引物如SEQ ID NO.5所示；下游引物如SEQ ID NO.6所示；引物对四：上游引物如SEQ ID NO.7所示；下游引物如SEQ ID NO.8所示；引物对五：上游引物如SEQ ID NO.9所示；下游引物如SEQ ID NO.10所示；引物对六：上游引物如SEQ ID NO.11所示；下游引物如SEQ ID NO.12所示；引物对七：上游引物如SEQ ID NO.13所示；下游引物如SEQ ID NO.14所示；引物对八：上游引物如SEQ ID NO.15所示；下游引物如SEQ ID NO.16所示；引物对九：上游引物如SEQ ID NO.17所示；下游引物如SEQ ID NO.18所示；引物对十：上游引物如SEQ ID NO.19所示；下游引物如SEQ ID NO.20所示；引物对十一：上游引物如SEQ ID NO.21所示；下游引物如SEQ ID NO.22所示；引物对十二：上游引物如SEQ ID NO.23所示；下游引物如SEQ ID NO.24所示；引物对十三：上游引物如SEQ ID NO.25所示；下游引物如SEQ ID NO.26所示；引物对十四：上游引物如SEQ ID NO.27所示；下游引物如SEQ ID NO.28所示；引物对十五：上游引物如SEQ ID NO.29所示；下游引物如SEQ ID NO.30所示；引物对十六：上游引物如SEQ ID NO.31所示；下游引物如SEQ ID NO.32所示；引物对十七：上游引物如SEQ ID NO.33所示；下游引物如SEQ ID NO.34所示；引物对十八：上游引物如SEQ ID NO.35所示；下游引物如SEQ ID NO.36所示；引物对十九：上游引物如SEQ ID NO.37所示；下游引物如SEQ ID NO.38所示；引物对二十：上游引物如SEQ ID NO.39所示；下游引物如SEQ ID NO.40所示；引物对二十一：上游引物如SEQ ID NO.41所示；下游引物如SEQ ID NO.42所示。