[发明专利]基于第三代测序序列的补洞方法及装置有效
| 申请号： | 201810581026.8 | 申请日： | 2018-06-05 |
| 公开（公告）号： | CN108763871B | 公开（公告）日： | 2022-05-31 |
| 发明（设计）人： | 周义其;李季;张锦波;蒋智;李瑞强 | 申请（专利权）人： | 北京诺禾致源科技股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10 |
| 代理公司： | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人： | 赵囡囡;董文倩 |
| 地址： | 100083 北京市昌平区*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于第三代测序序列的补洞方法及装置。其中，该方法包括：对三代测序序列中包含的至少一个子测序序列进行比对，得到第一比对结果；从第一比对结果中提取位于至少一个gap序列一定范围内的子测序序列，得到至少一个第一提取结果；对第一提取结果进行精细比对，得到第二比对结果；从第二比对结果中提取位于至少一个gap序列一定范围内的子测序序列，得到至少一个第二提取结果；将至少一个第二提取结果进行组装，得到一致性序列；使用一致性序列替换基因组草图中的原有序列；其中，gap序列为未知序列。本发明解决了在对测序数据进行基因组补洞的过程中，比对测序序列的过程速度很慢，导致资源消耗较大的技术问题。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 第三代 序列 方法 装置 | ||
【主权项】：
1.一种基于第三代测序序列的补洞方法，其特征在于，包括：对三代测序序列中包含的至少一个子测序序列进行比对，得到第一比对结果；从所述第一比对结果中提取位于至少一个gap序列一定范围内的子测序序列，得到至少一个第一提取结果；对所述第一提取结果进行精细比对，得到第二比对结果；从所述第二比对结果中提取位于至少一个gap序列一定范围内的子测序序列，得到至少一个第二提取结果；将所述至少一个第二提取结果进行组装，得到一致性序列；使用所述一致性序列替换基因组草图中的原有序列；其中，所述gap序列为未知序列。
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