[发明专利]一种自动检测分节段RNA病毒重配的方法有效
| 申请号： | 201810586291.5 | 申请日： | 2018-06-08 |
| 公开（公告）号： | CN108846258B | 公开（公告）日： | 2021-05-18 |
| 发明（设计）人： | 任洪广;梁龙;岳俊杰;靳远;黄志松;周静;胡明达;彭小川;周江林 | 申请（专利权）人： | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;G16B30/10 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅;白艳 |
| 地址： | 100071*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种自动检测分节段RNA病毒重配的方法。本发明提供了一种基于病毒各个节段系统发育树进化关系进行病毒重配检测的方法，包括如下步骤：1)建立病毒各个节段系统发育树；2)将步骤1)得到的分节段系统发育树进行依据平均成对距离的聚类划分，得到每个毒株的各个节段的划分类重定义；3)依据该定义可实现病毒毒株的重配历史检测，同时对于新毒株数据，可依据分节段相似度进行相应的重配检测。本发明的实验证明，本发明通过进化树聚类划分，不需要进行各个节段的拼接比对即可实现对病毒毒株重配的检测，检测结果合理高效。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 自动检测 分节 rna 病毒 方法 | ||
【主权项】：
1.一种待测病毒基因组分节片段重配检测的方法，为先构建已有病毒的各个节段的系统发育树，再依据所述系统发育树中分支节点和叶节点的距离分布进行聚类划分，获得各个节段的划分类，依据现有病毒或待测病毒与划分类的映射关系，获得对病毒重配过程的溯源分析或检测。
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