[发明专利]癌细胞HER2基因扩增分析方法及系统有效

专利信息
申请号: 201810597306.8 申请日: 2018-06-11
公开(公告)号: CN109147932B 公开(公告)日: 2020-11-10
发明(设计)人: 刘娟;陈哲;袁静萍;汤永飞;贺华;段慧芳 申请(专利权)人: 武汉海星通技术股份有限公司
主分类号: G16H50/20 分类号: G16H50/20;G06T7/00;G06T7/11;G06T7/62
代理公司: 武汉开元知识产权代理有限公司 42104 代理人: 刘琳
地址: 430000 湖北省武汉市江汉区武汉中*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明公开了一种癌细胞HER2基因扩增分析方法及系统,本发明通过红点成簇分析、红点识别、绿点识别、构建细胞核特征矩阵、分割细胞核的面积、圆形度、计算每个细胞的比值均值、绿点均值、红点均值、判断HER2基因是否扩增的过程,输出基于HER2基因是否扩增的FISH检测结果报告。本发明用癌细胞FISH图像进行HER2基因扩增检测分析,模拟病理学家诊断流程可以有效的通过计算机识别FISH图像的红绿点比值从而判断出her2基因是否扩增,为病理医生减轻工作量。
搜索关键词: 癌细胞 her2 基因 扩增 分析 方法 系统
【主权项】:
1.一种癌细胞HER2基因扩增分析方法,其特征在于:所述方法包括如下步骤:1)对FISH图像的红色通道图像进行红点成簇分析,若单红点成簇总数超过设定值,则直接判定为HER2基因扩增,转步骤7),否则转步骤2);2)对FISH图像的红色通道图像进行红点识别,对绿色通道图像进行绿点识别;3)对每一个细胞构建存储细胞核特征的矩阵;4)运用FISH图像的细胞核分割方法得到细胞核的面积、圆形度;5)计算每个细胞核内的红绿点数目,并计算每个细胞的比值均值、绿点均值、红点均值,将得到结果存入存储细胞核特征的矩阵中;6)根据存储细胞核特征的矩阵判断HER2基因是否扩增;7)根据HER2基因扩增判定结果输出基于HER2基因是否扩增的FISH检测结果报告。
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