[发明专利]一种全基因组规模获取花生种子特异表达基因的方法及其应用在审
| 申请号： | 201810627703.5 | 申请日： | 2018-06-19 |
| 公开（公告）号： | CN108707651A | 公开（公告）日： | 2018-10-26 |
| 发明（设计）人： | 孙全喜;苑翠玲;王传堂;王秀贞;唐月异;吴琪;王志伟 | 申请（专利权）人： | 山东省花生研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12N15/113 |
| 代理公司： | 青岛合创知识产权代理事务所(普通合伙) 37264 | 代理人： | 王晓晓 |
| 地址： | 266199 山*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种全基因组规模获取花生种子特异表达基因的方法及其应用。本发明可以在全基因组规模筛选获得花生种子特异表达基因，并且可以将种子特异表达基因按表达量的高低进行排列；该方法将植物组织分为种子组织和非种子组织，大大降低了转录组测序花费，增加了获取种子特异表达基因的准确度。本发明提供的全基因组规模获取花生种子特异表达基因的方法在鉴定花生种子特异表达启动子中的应用，有助于基因组规模筛选获取花生种子特异表达启动子。本发明对花生及其他植物高表达种子特异启动子的克隆和鉴定具有重要的应用价值；本发明对获取花生其它组织特异表达基因以及其它植物组织特异表达基因也具有重要的应用价值。 | ||
| 搜索关键词： | 特异表达基因 花生种子 全基因组 应用 特异表达启动子 植物组织 种子组织 花生 种子特异启动子 组织特异表达 筛选 基因组规模 准确度 表达量 高表达 转录组 测序 克隆 基因 | ||
【主权项】：
1.一种全基因组规模获取花生种子特异表达基因的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：（1）分别取花生发芽出苗期的根、幼苗期的茎、开花下针期的叶片、结荚期的花和饱果成熟期的果针、果壳以及果针入土10天、20天、30天、40天、50天、60天和70天种子，液氮冻存，‑80℃保存备用；（2）提取（1）中各组织RNA，将果针入土10天、20天、30天、40天、50天、60天和70天种子相等质量的RNA混合作为样品1，上述根、茎、叶片、花、果针、果壳相等质量的RNA混合作为样品2；（3）将样品1和样品2分别进行转录组测序，找到只在样品1中检测到而在样品2中未检测到的目标基因；（4）利用RT‑PCR检测目标基因在花生根、茎、叶片、花、果针、果壳以及种子中的表达情况，只在花生种子中检测到表达的基因即为种子特异基因。
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