[发明专利]一种基于点割集的LncRNA与疾病关联关系的预测方法有效
| 申请号： | 201810638833.9 | 申请日： | 2018-06-20 |
| 公开（公告）号： | CN108959854B | 公开（公告）日： | 2021-08-03 |
| 发明（设计）人： | 匡林爱;赵皓晨;王雷;轩占伟;喻景雯;裴廷瑞 | 申请（专利权）人： | 湘潭大学 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;G16H50/70 |
| 代理公司： | 长沙朕扬知识产权代理事务所(普通合伙) 43213 | 代理人： | 马家骏 |
| 地址： | 411100 *** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种生物信息领域的基于点割集的LncRNA与疾病关联关系的预测方法，包括以下步骤：构建LncRNA与疾病的相互作用网络；基于所述相互作用网络构建邻接矩阵；基于所述邻接矩阵构建最短跳矩阵；根据所述邻接矩阵与所述最短跳矩阵收集所述相互作用网络中节点的点割集；根据所述点割集构建距离相关系数矩阵；根据所述距离相关系数矩阵、疾病节点之间的欧氏距离、疾病节点的数据差异、LncRNA节点之间的欧氏距离、LncRNA节点的数据差异和疾病节点与LncRNA节点的关联强相关值构建距离差异矩阵；根据距离差异矩阵计算节点对的相关度，并根据节点对的相关度构建节点关联度矩阵；分解所述节点关联度矩阵得到供LncRNA与疾病关联关系预测的预测子矩阵。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 点割集 lncrna 疾病 关联 关系 预测 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于点割集的LncRNA与疾病关联关系的预测方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：构建LncRNA与疾病的相互作用网络；S2：基于所述相互作用网络构建邻接矩阵；S3：基于所述邻接矩阵构建最短跳矩阵；S4：根据所述邻接矩阵与所述最短跳矩阵收集所述相互作用网络中节点的点割集；S5：根据所述点割集构建距离相关系数矩阵；S6：根据所述距离相关系数矩阵、疾病节点之间的欧氏距离、疾病节点的数据差异、LncRNA节点之间的欧氏距离、LncRNA节点的数据差异和疾病节点与LncRNA节点的关联强相关值构建距离差异矩阵；S7：根据距离差异矩阵计算节点对的相关度，并根据节点对的相关度构建节点关联度矩阵；S8：分解所述节点关联度矩阵得到供LncRNA与疾病关联关系预测的预测子矩阵以根据预测子矩阵验证LncRNA与疾病关联关系的准确性。
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