[发明专利]基于结构网络模型的蛋白质功能位点预测方法有效
| 申请号： | 201810643576.8 | 申请日： | 2018-06-21 |
| 公开（公告）号： | CN108830043B | 公开（公告）日： | 2021-03-30 |
| 发明（设计）人： | 严文颖;沈百荣;杨洋 | 申请（专利权）人： | 苏州大学 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B40/00 |
| 代理公司： | 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 32257 | 代理人： | 杨慧林 |
| 地址： | 215131 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于结构网络模型的蛋白质功能位点预测方法，包括：预测蛋白质结合位点；输入关于演化、物理化学性质、结构以及动态性这四个方面衡量蛋白质中每个残基的性质；基于蛋白质的三维结构对每个蛋白质构建其点加权的蛋白质结构网络(Node‑weighted Protein Structure Network，NPSN)；定义并计算点加权的蛋白质结构网络的参数；基于以上网络参数，利用随机森林模型预测蛋白质中的别构残基的概率。整合残基物理化学性质、序列信息、蛋白质结构特征、动态特征，节省时间，适用于大规模的、批量蛋白质功能位点预测，并提高预测的准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 结构 网络 模型 蛋白质 功能 预测 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于结构网络模型的蛋白质功能位点预测方法，其特征在于，包括：预测所述蛋白质结合位点；输入关于演化、物理化学性质、结构以及动态性这四个方面衡量蛋白质中每个残基的性质；基于蛋白质的三维结构对每个蛋白质构建其点加权的蛋白质结构网络(Node‑weighted Protein Structure Network，NPSN)；定义并计算点加权的蛋白质结构网络的参数；基于以上网络参数，利用随机森林模型预测蛋白质中的别构残基的概率。
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