[发明专利]一种利用宏基因组数据分析微生物群体功能的方法

摘要

本发明提供一种利用宏基因组数据分析微生物群体功能的方法，采集已知所有微生物物种、基因和功能信息，将这些信息整合为参考数据库；对待测微生物群体的宏基因组进行测序，控制测序数据质量，计算物种丰度和基因丰度，分析不同样本间微生物的组成差异和基因水平差异；对基因功能注释，将相同功能的基因聚类，得到功能模块，将各个功能模块中所有非冗余基因的相关丰度进行加合计算，得到所有功能模块的丰度值，对待测样本微生物的功能进行差异比较分析或整体评价。本发明方法省去了拼接、组装、预测和测序数据与单一功能数据库分别比对的分析步骤，节省时间，提高测序数据利用率，可用于高通量微生物全基因组测序数据的分析和筛选功能微生物。

主权项

1.一种微生物宏基因组参考数据库，其特征在于，该参考数据库包括微生物物种数据集和微生物基因和功能数据集；所述微生物物种数据集整合广泛宿主和环境来源的微生物物种信息；所述微生物基因和功能数据集整合广泛宿主和环境来源的微生物基因信息和功能的注释信息。