[发明专利]一种GII.8型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法有效
申请号: | 201810646112.2 | 申请日: | 2018-06-21 |
公开(公告)号: | CN108796128B | 公开(公告)日: | 2021-07-27 |
发明(设计)人: | 薛亮;吴清平;蔡伟程;张乐;蔡淑珍;张菊梅 | 申请(专利权)人: | 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心);广东环凯微生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6869;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星 |
地址: | 510070 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种GII.8型诺如病毒基因组的扩增引物和扩增方法。本发明针对GII.8型诺如病毒基因组特征采用了“4+1+1”的分段扩增策略,在保守区域设计了六组扩增引物和两条基因组末端测序引物,以目标病毒RNA为模板进行RT‑PCR扩增与测序,再通过拼接比对,获得GII.8型诺如病毒基因组序列。将该扩增方法应用于实际检出样本,成功获得我国来源的GII.8型诺如病毒基因组序列。本发明方法具有操作简单、周期短、易推广等优点,可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求及相应的科研领域。 | ||
搜索关键词: | 一种 gii 型诺如 病毒 基因组 扩增 引物 方法 | ||
【主权项】:
1.一种GII.8型诺如病毒基因组扩增引物,其特征在于,包括六对扩增引物和两条基因组末端的测序引物:引物对1:II‑1F:5'‑GTGAATGAAGATGGCGTCTAAC‑3';II.8‑1R:5'‑CTGTAGGCATCCCAGTGATC‑3';引物对2:II.8‑2F:5'‑TCATCTTCGCCTGACATCGT‑3';II.8‑2R:5'‑TCCTCTTCACAGAAGTTCTC‑3';引物对3:II.8‑3F:5'‑CACACTGCATTCTCCAGCAA‑3';II.8‑3R:5'‑CAATCCTCCAAATGCCCGA‑3';引物对4:II.8‑4F:5'‑GAGGAAGCCAAGAAGACAGT‑3';II‑4R:5'‑CCRCCNGCATRHCCRTTRTACAT‑3';引物对5:II‑5F:5'‑GGAGGGCGATCGCAATC‑3';II‑5R:5'‑CCRGCRAAGAAAGCTCCAGCCAT‑3';引物对6:II.8‑6F:5'‑TCYAACAGTGGGGACCACC‑3';II.8‑6R:5'‑TCACTAAGCCCGTGACTCC‑3';测序引物:II.8‑seq1R:5'‑AACTCACCATCCCACATCTC‑3';II.8‑seq6F:5'‑GACAAGGAGATGTTGAATGC‑3';R代表A/G,H代表A/C/T,N代表碱基A/C/T/G,Y代表C/T。
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