[发明专利]确定检测靶点的方法、装置、计算机设备和存储介质有效
| 申请号： | 201810651693.9 | 申请日： | 2018-06-22 |
| 公开（公告）号： | CN110021365B | 公开（公告）日： | 2021-01-22 |
| 发明（设计）人： | 孙亚洲;杜刘稳;陈斌;牛团结;肖贡;郭婷;曾柳眉;陈杰 | 申请（专利权）人： | 深圳市达仁基因科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B50/00 | 分类号： | G16B50/00;G16B30/00 |
| 代理公司： | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人： | 孙凯乐 |
| 地址： | 518000 广东省深圳市前海深港合作区前*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本申请涉及一种确定检测靶点的方法、系统、计算机设备和存储介质。方法包括：确定待检测的目标病原体操作组；从靶点数据库中获取目标病原体操作组中包含的特异性k‑mer；确定目标病原体操作组中包含的每个基因组中包含的特异性k‑mer；对每个基因组包含的特异性k‑mer进行处理，得到每个基因组对应的非重合特异性区域集合；获取每个基因组对应的非重合特异性区域集合中包含的每个非重合特异性区域在全部非重合特异性区域集合中的出现次数；选取出现次数超过预设次数阈值的非重合特异性区域作为目标病原体操作组的检测靶点。这种技术方案大大扩大了潜在检测靶点的搜寻范围，增加了对检测靶点搜索范围限定的灵活性，提高了确定检测靶点的效率。 | ||
| 搜索关键词： | 确定 检测 方法 装置 计算机 设备 存储 介质 | ||
【主权项】：
1.一种确定检测靶点的方法，所述方法包括：确定待检测的目标病原体操作组；从靶点数据库中获取所述目标病原体操作组中包含的特异性k‑mer，所述特异性k‑mer为满足预设特异性条件的k‑mer，k‑mer是指长度为k的基因组序列；确定所述目标病原体操作组中包含的每个基因组中包含的特异性k‑mer；对每个基因组包含的特异性k‑mer进行处理，得到每个基因组对应的非重合特异性区域集合，所述非重合特异性区域集合中包含有非重合特异性区域；获取每个基因组对应的非重合特异性区域集合中包含的每个非重合特异性区域在全部非重合特异性区域集合中的出现次数；选取所述出现次数超过预设次数阈值的非重合特异性区域作为所述目标病原体操作组的检测靶点。
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