[发明专利]GBS获取白菜类作物基因组SNP构建指纹图谱的方法在审
| 申请号： | 201810651703.9 | 申请日： | 2018-06-22 |
| 公开（公告）号： | CN108913797A | 公开（公告）日： | 2018-11-30 |
| 发明（设计）人： | 孙日飞;李国亮;张淑江;程锋;李菲;章时蕃;张慧 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君;黄爽 |
| 地址： | 100081 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明提供一种基于GBS技术获取白菜类作物全基因组高密度SNP位点构建指纹图谱的方法，包括：(1)设计不同的酶切方案，预测单酶切或双酶切白菜类材料基因组所获得的酶切片段分布情况；(2)根据酶切片段分布特点设计条形码接头及PCR扩增引物；(3)构建简化基因组测序文库；(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序；(5)根据测序结果获得SNP标记位点，用于构建指纹图谱。本发明为不同白菜类作物材料利用GBS构建全基因组高密度SNP图谱提供了一种通用策略，该方法降低了测序成本，酶切位点在基因组上分布均匀，利用本方法对100份白菜类材料进行了测序，费用可降低70％左右，获得的多态性位点足够用于性状分析。 | ||
| 搜索关键词： | 构建 基因组 测序 白菜类作物 指纹图谱 酶切片段 全基因组 白菜 多态性位点 材料利用 测序文库 分布特点 技术获取 结果获得 酶切位点 性状分析 单酶切 双酶切 条形码 酶切 位点 上机 文库 图谱 通用 预测 | ||
【主权项】：
1.基于GBS技术获取白菜类作物全基因组高密度SNP位点构建指纹图谱的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)按照表1的酶切方案，预测单酶切或双酶切白菜类材料基因组所获得的酶切片段分布情况；(2)根据酶切片段分布特点设计条形码接头及PCR扩增引物；(3)构建简化基因组测序文库；(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序；(5)根据测序结果获得SNP标记位点，用于构建指纹图谱；表1酶切方案![]()
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国农业科学院蔬菜花卉研究所，未经中国农业科学院蔬菜花卉研究所许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201810651703.9/，转载请声明来源钻瓜专利网。
