[发明专利]一种通过血液样本判断肺结节良恶性的方法在审

专利信息
申请号: 201810759269.6 申请日: 2018-07-11
公开(公告)号: CN108949979A 公开(公告)日: 2018-12-07
发明(设计)人: 温媛;周衍庆;陈实富;张实唯 申请(专利权)人: 深圳市海普洛斯生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886
代理公司: 北京联瑞联丰知识产权代理事务所(普通合伙) 11411 代理人: 陈剑聪
地址: 518000 广东省深圳市南山区高*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了一种通过血液样本判断肺结节良恶性的方法,其是使用cfDNA多基因变异结合机器学习来判定,包括对肺结节患者外周血cfDNA进行文库构建,并采用肺癌相关18个基因捕获探针对cfDNA进行杂交捕获,使用测序仪进行测序,分析每个基因的累计突变频率,使用逻辑回归的模型判断样本的良恶性。本发明能够高灵敏度、高特异性的区分肺部结节患者的良恶性,避免了人工读取CT影像学的经验错误,避免了肺癌的漏检以及良性结节患者穿刺或者手术取样活检的痛苦。
搜索关键词: 肺结节 血液样本 肺癌 肺部结节 高灵敏度 基因捕获 机器学习 良性结节 逻辑回归 模型判断 取样活检 人工读取 突变频率 文库构建 杂交捕获 穿刺 测序仪 多基因 外周血 测序 漏检 判定 样本 基因 痛苦 分析
【主权项】:
1.一种通过血液样本判断肺结节良恶性的方法,其特征在于,其是使用cfDNA多基因变异结合机器学习来判定,包括如下步骤:S1.对肺结节患者外周血cfDNA进行文库构建;S2.采用肺癌相关18个基因捕获探针对cfDNA进行杂交捕获,该18个基因分别为STAT3、DDR2、STAT3、ERBB3、SOD2、RAF1、ERBB4、AKT1、SLIT1、NTRK1、DDR2、KEAP1、NOTCH1、TSC2、JAK2、JAK2、EGFR和ATM;S3.使用测序仪进行测序,对测序数据进行数据分析,分析每个基因的累计突变频率,使用逻辑回归的模型判断样本的良恶性。
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