[发明专利]一种预测疾病与LncRNA关联关系的方法及系统有效
| 申请号： | 201810799121.5 | 申请日： | 2018-07-19 |
| 公开（公告）号： | CN109243538B | 公开（公告）日： | 2021-11-23 |
| 发明（设计）人： | 王雷;轩占伟;匡林爱;李学勇;陈治平;谭义红 | 申请（专利权）人： | 长沙学院 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;G16B50/30;G16H50/20;G16H50/70 |
| 代理公司： | 长沙朕扬知识产权代理事务所(普通合伙) 43213 | 代理人： | 何湘玲 |
| 地址： | 410000 湖*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种预测疾病与LncRNA关联关系的方法和系统，包括：从已知数据库获取LncRNA‑miRNA关联关系和miRNA‑疾病关联关系，根据二者构建LncRNA‑miRNA‑疾病相互作用网络；基于LncRNA‑miRNA‑疾病相互作用网络，构建疾病超级表达谱和LncRNA的超级表达谱；根据疾病超级表达谱和LncRNA的超级表达谱，采用基于RBF神经网络的LncRNA相似性计算和疾病相似性计算，训练疾病与LncRNA关联关系的预测模型；使用预测模型对候选样本的LncRNA‑疾病关联对进行预测。本发明提供最有希望的LncRNA疾病关联进一步的实验验证，能够有效的从海量生物数据中挖掘潜在的疾病相关的LncRNA,降低生物实验成本与开销，加快生物信息领域研究进展。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 预测 疾病 lncrna 关联 关系 方法 系统 | ||
【主权项】：
1.一种预测疾病与LncRNA关联关系的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：从已知数据库获取LncRNA‑miRNA关联关系和miRNA‑疾病关联关系，根据二者构建LncRNA‑miRNA‑疾病相互作用网络；S2：基于所述LncRNA‑miRNA‑疾病相互作用网络，构建疾病超级表达谱和LncRNA的超级表达谱；S3：根据所述疾病超级表达谱和LncRNA的超级表达谱，采用基于RBF神经网络的LncRNA相似性计算和疾病相似性计算，训练疾病与LncRNA关联关系的预测模型；S6：使用预测模型对候选样本的LncRNA‑疾病关联对进行预测。
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