[发明专利]一种同源基因特异性甲基化时序数据的分析方法有效
| 申请号： | 201810833596.1 | 申请日： | 2018-07-26 |
| 公开（公告）号： | CN108920904B | 公开（公告）日： | 2022-05-27 |
| 发明（设计）人： | 吉冠玉;吉红玉;王君文;胡琪;高飞 | 申请（专利权）人： | 深圳市易基因科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;G16B20/30;G16B20/50 |
| 代理公司： | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人： | 汤东凤 |
| 地址： | 518000 广东省深圳市坪山新区坪*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种同源基因特异性甲基化时序数据的分析方法，属于基因组学和分子生物技术领域。该方法首先利用DNA甲基化测序数据序列特征和突变信息判定ASM区域，筛选出每个时期或者组别中特有的所述ASM区域，之后结合不同突变型对应的甲基化信息，利用某个时期的甲基化信息和其他不同时期样品进行比较，初步判定出原始时期特异性ASM区域，最后通过统计所有所述原始时期特异性ASM区域内的差异以及全部CpG位点数目，采用超几何检验，判定所述ASM区域是否为最终的时期特异性同源基因特异性甲基化区域。本发明进一步深化分析挖掘甲基化信息，可以检测多个不同阶段基于重亚硫酸盐处理的数据的ASM动态变化。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 同源 基因 特异性 甲基化 时序 数据 分析 方法 | ||
【主权项】：
1.一种同源基因特异性甲基化时序数据的分析方法，其特征在于，包括如下步骤：首先利用DNA甲基化测序数据序列特征和突变信息判定ASMR区域，筛选出每个时期或者组别中特有的所述ASMR区域，之后结合不同突变型对应的甲基化信息，利用某个时期的甲基化信息和其他不同时期样品进行比较，初步判定出原始时期特异性的ASMR区域，最后通过统计所有所述原始时期特异性ASMR区域内的差异以及全部CG位点数目，采用超几何检验，判定所述AMSR区域为最终的时期特异性同源基因特异性甲基化区域。
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