[发明专利]基因变异数据的GDS-Huffman压缩方法在审
申请号: | 201810836104.4 | 申请日: | 2018-07-26 |
公开(公告)号: | CN109192245A | 公开(公告)日: | 2019-01-11 |
发明(设计)人: | 邓元帅;李伟忠 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;H03M7/40 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 林丽明 |
地址: | 510275 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及一种基因变异数据的GDS‑Huffman压缩方法,对于GVCF文件,基于GDS压缩方法根据基因型频率采用Huffman编码对GVCF文件中的基因型进行编码,而采用变长整型编码的方式对GVCF文件中的整型字段进行编码,得到压缩后的GDS文件。 | ||
搜索关键词: | 压缩 基因变异 整型 基因型频率 基因型 字段 | ||
【主权项】:
1.一种基因变异数据的GDS‑Huffman压缩方法,其特征在于:对于GVCF文件,基于GDS压缩方法根据基因型频率采用Huffman编码对GVCF文件中的基因型进行编码,而采用变长整型编码的方式对GVCF文件中的整型字段进行编码,得到压缩后的GDS文件。
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