[发明专利]一种基于卷积神经网络和规划动态算法的RNA二级结构生成器及其预测方法有效
申请号: | 201810851933.X | 申请日: | 2018-07-30 |
公开(公告)号: | CN110021340B | 公开(公告)日: | 2021-04-02 |
发明(设计)人: | 张浩;张春鹤;刘元宁;魏旭;常浩武;李聪 | 申请(专利权)人: | 吉林大学 |
主分类号: | G16B15/00 | 分类号: | G16B15/00;G16B30/10 |
代理公司: | 北京远大卓悦知识产权代理有限公司 11369 | 代理人: | 姜美洋 |
地址: | 130000 吉*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于卷积神经网络和规划动态算法的RNA二级结构生成器,包括:微处理器;存储单元,处理单元,其包括:预处理单元,负责获取缓存单元中RNA数据,并对所述RNA数据进行预处理;滑动窗口单元,其连接所述预处理单元,用于将经过预处理后的RNA数据分割为大小相同的RNA二维数组;卷积神经网络模型单元,其以前期收集的大量RNA测序及其结构数据为基础,构建卷积神经网络模型,对序列内各个碱基进行分类预测;规划动态算法单元,其用于修正卷积神经网络模型单元的预测结果,还公开了一种基于卷积神经网络和规划动态算法的RNA二级结构预测方法。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 卷积 神经网络 规划 动态 算法 rna 二级 结构 生成器 及其 预测 方法 | ||
【主权项】:
1.一种基于卷积神经网络和规划动态算法的RNA二级结构生成器,其特征在于,包括:微处理器;存储单元,其包括:内存储单元,其用于RNA初始数据的存储;缓存单元,其连接所述内存储单元;存储单元,其与所述缓存单元连接,用于完成所述RNA二级结构预测结果数据的存储;处理单元,其包括:预处理单元,其用于获取缓存单元中RNA数据,并对所述RNA数据进行预处理;滑动窗口单元,其连接所述预处理单元,用于将经过预处理后的RNA数据分割为大小相同的核苷酸序列二维数组;卷积神经网络模型单元,其以RNA测序及其结构数据为基础,构建卷积神经网络模型,对序列内各个碱基进行分类预测;规划动态算法单元,其用于修正卷积神经网络模型单元的预测结果。
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