[发明专利]一种通过LC-MS检测核酸表观遗传修饰的方法有效
| 申请号： | 201810896131.0 | 申请日： | 2018-08-08 |
| 公开（公告）号： | CN108872459B | 公开（公告）日： | 2020-12-22 |
| 发明（设计）人： | 谷晓峰;张倩 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院生物技术研究所 |
| 主分类号： | G01N30/88 | 分类号： | G01N30/88 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅;何叶喧 |
| 地址： | 100081 北京市海淀区中关*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种通过LC‑MS检测核酸表观遗传修饰的方法，具体涉及一种检测核糖核酸(RNA)中甲基化修饰的核糖核苷酸的丰度的方法和一种检测脱氧核糖核酸(DNA)中甲基化修饰的脱氧核糖核苷酸的丰度的方法。包括如下步骤：(1)提取生物样本的核酸，进行单核苷酸制备，然后进行去磷酸化，然后纯化单核苷酸，得到上机样本；(2)采用液相色谱‑质谱联用仪对上机样本进行检测，获得丰度结果。本发明对于核酸表观遗传修饰的研究领域具有重大的应用推广价值。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 通过 lc ms 检测 核酸 表观 遗传 修饰 方法 | ||
【主权项】：
1.一种通过LC‑MS检测生物样本的核糖核酸中N6‑甲基腺嘌呤核糖核苷酸的丰度的方法，包括如下步骤：(1)提取生物样本的RNA，进行单核苷酸制备，然后进行去磷酸化，然后纯化单核苷酸，得到上机样本；(2)采用液相色谱‑质谱联用仪对上机样本进行检测，获得核糖核酸中N6‑甲基腺嘌呤核糖核苷酸的丰度；质谱中，m/z参数设置为282.1‑150.1，CID参数设置为16；液相色谱中，A相为乙腈,B相为0.1％甲酸水溶液；液相色谱中，洗脱过程如下：第0‑7min，A相占流动相的体积比由0线性上升至1％；第7‑10.5min，A相占流动相的体积比由1％线性上升至6％；第10.5‑15min，A相占流动相的体积比由6％线性上升至100％；第15‑20min，A相占流动相的体积份数由100％线性下降至0。
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