[发明专利]基于高通量测序技术鉴定鱼卵仔稚鱼的方法在审
| 申请号： | 201810954202.8 | 申请日： | 2018-08-21 |
| 公开（公告）号： | CN109097481A | 公开（公告）日： | 2018-12-28 |
| 发明（设计）人： | 徐春燕;朱志煌;林汉青;沈长春;蔡建堤;林琪;刘勇;马超;庄之栋 | 申请（专利权）人： | 福建省水产研究所（福建水产病害防治中心）;福建省环安检测评价有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京挺立专利事务所(普通合伙) 11265 | 代理人： | 叶树明 |
| 地址： | 361000 *** | 国省代码： | 福建;35 |
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| 摘要： | 本发明公开了基于高通量测序技术鉴定鱼卵仔稚鱼的方法，野外采集鱼卵仔稚鱼样品，现场保存于95％的酒精当中；使用DNeasy Blood&Tissue Kit试剂盒提取样品基因组DNA；采用Cytb通用引物对上述基因组DNA进行PCR扩增；对PCR扩增产物进行高通量测序；将获得的基因序列进行序列筛选、比对，通过经高通量基因测序平台产生的序列与公共数据库NCBI中序列进行对比，根据基因序列相似指数判断鱼卵仔稚鱼物种归属，整个方法过程不需对每个样品提取DNA、PCR扩增和测序，相比传统耗时耗力的单一物种鉴定，高通量方法能在短时间内对大量复合样本进行物种鉴定，既省时又省力。 | ||
| 搜索关键词： | 仔稚鱼 鱼卵 高通量测序技术 基因组DNA 基因序列 高通量 高通量测序 公共数据库 通用引物对 单一物种 复合样本 基因测序 物种鉴定 相似指数 序列筛选 样品提取 野外采集 试剂盒 比对 测序 省力 省时 耗时 酒精 归属 物种 保存 | ||
【主权项】：
1.基于高通量测序技术鉴定鱼卵仔稚鱼的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：S1：野外采集鱼卵仔稚鱼样品，现场保存于95％的酒精当中；S2：使用DNeasy Blood&Tissue Kit试剂盒提取样品基因组DNA；S3：采用Cytb通用引物对S2中所述基因组DNA进行PCR扩增；S4：对PCR扩增产物进行高通量测序，获得目的基因的序列信息；S5：将获得的基因序列进行序列筛选、比对，通过经高通量基因测序平台产生的序列与公共数据库NCBI中序列进行对比，根据基因序列相似指数判断鱼卵仔稚鱼物种归属。
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